Alphacoronavirus -Alphacoronavirus

Alphacoronavirus
12985 2015 421 Fig1 HTML.webp
Svinepidemisk diarévirus genom og virionstruktur
Virusklassificering e
(uden rangering): Virus
Rige : Riboviria
Kongerige: Orthornavirae
Phylum: Pisuviricota
Klasse: Pisoniviricetes
Bestille: Nidovirales
Familie: Coronaviridae
Underfamilie: Orthocoronavirinae
Slægt: Alphacoronavirus
Subgenera og arter

Se tekst

Alphacoronaviruses (Alpha-CoV) er medlemmer af den første af de fire slægter ( Alpha- , Beta- , Gamma- og Delta- ) af coronavirus . De er positivt sansede , enkeltstrengede RNA-vira, der inficerer pattedyr , herunder mennesker . De har sfæriske virioner med kølleformede overfladefremspring dannet af trimere af piggproteinet og en viral konvolut .

Alphacoronavirus findes i underfamilien Orthocoronavirinae af familien Coronaviridae . Både Alpha- og Betacoronavirus -slægterne stammer fra den virale gen -pulje af flagermus . Alphacoronavirus var tidligere kendt som " phylogroup 1 coronavirus".

Etymologi

Navnet alphacoronavirus stammer fra oldgræsk ἄλφα ( álpha , "det første bogstav i det græske alfabet ") og κορώνη (korṓnē, "krans, krans"), hvilket betyder krone, der beskriver udseendet af overfladefremspringene set under elektronmikroskopi der ligner en solcorona .

Struktur

Virionen er indhyllet og sfærisk og måler 120-160 nm i diameter og en kerneskal på ca. 65 nm. Glycoproteiner og trimere danner store overfladefremspring, der skaber solcorona. Denne slægt har, ligesom andre coronavirus, et piggprotein med en type I fusionsmaskine (S2) og et receptorbindende domæne (S1). Det samles til en trimer. I modsætning til beta- og gammacoronavirus spaltes dette protein ikke i to halvdele.

Genom

Genetiske forhold mellem de forskellige feline coronavirus (FCov) og canine coronavirus (CCoV) genotyper. Rekombination ved pile.

Genomet er positivt sanset , enkeltstrenget RNA med en længde på 27 til 29 kilobaser og en 3'-polyA-hale. To store, overlappende ORF'er i genomets 5'-ende koder for de store ikke-strukturelle proteiner udtrykt som et fusionsprotein ved ribosomalt rammeskift . Disse inkluderer regioner med protease- , helicase- og RNA -polymerasemotiver. Der er syv andre gener nedstrøms, som koder for strukturelle proteiner. Disse udtrykkes fra et 3'-koterminal indlejret sæt subgenomiske mRNA'er .

Rekombination

Begge typer Alphacoronavirus 1 , feline coronavirus (FCoV) og canine coronavirus (CCoV) vides at eksistere i to serotyper. Serotype II retter sig mod Aminopeptidase N , mens receptoren for Serotype I er ukendt. Forskellen skyldes et andet piggprotein. Der er en fælles forfader for FCoV og CCoV. Denne forfader udviklede sig gradvist til FCoV I og CCoV I. Et S -protein fra en ukendt virus blev rekombineret til forfaderen og gav anledning til CCoV II. CCoV II rekombinerede igen med FCoV for at oprette FCoV II. CCoV II udviklede sig gradvist til TGEV. En spids sletning i TGEV skaber PRCV. Alle disse vira er sorteret i underslægten Tegacovirus .

Klassifikation

Fylogent træ af slægten Alphacoronaviruses med værtsdyr angivet på højre side.

Følgende undergenerater og arter genkendes:

Se også

Referencer

eksterne links