Klynge 5 - Cluster 5

" Klynge 5 ", også kaldet ΔFVI-spike af Danish State Serum Institute (SSI), er en variant af SARS-CoV-2 , virussen, der forårsager COVID-19 , der menes at være uddød. Det blev opdaget i Nordjylland , Danmark , og menes at have været spredt fra mink til mennesker via minkfarme . Den 4. november 2020 blev det annonceret, at minkbestanden i Danmark ville blive slettet for at forhindre en mulig spredning af denne mutation og reducere risikoen for, at nye mutationer sker. En lockdown og rejsebegrænsninger blev indført i syv kommuner i Nordjylland for at forhindre mutationen i at sprede sig, hvilket kunne kompromittere nationale eller internationale reaktionerCOVID-19-pandemien .

Den Verdenssundhedsorganisationen (WHO) har udtalt, at klynge 5 har en "moderat nedsat følsomhed over for neutraliserende antistoffer". SSI advarede om, at mutationen kunne reducere virkningen af COVID-19-vacciner under udvikling, selvom det var usandsynligt, at det ville gøre dem ubrugelige. Efter lockdown og massetest meddelte SSI den 19. november 2020, at klynge 5 efter al sandsynlighed var uddød.

Baggrund

Amerikansk mink ( Neogale vison )

I 2019 var Danmark den største producent af minkskind i verden med langt størstedelen af ​​de danske gårde i det nordlige og vestlige Jylland . I de senere år havde industrien generelt været i tilbagegang i landet. Sammen med flagermus, pangoliner og mennesker er mink en af ​​de mange pattedyrarter , der kan inficeres med coronavirus .

I november 2020, da pangolins rolle i spredningen af COVID-19 gradvist bliver afvist af forskere, præsenterer sociolog og journalist for avisen Reporterre  [ fr ] Yann Faure i en artikel fra kriser dateret den 7. januar data, der vidner om muligheden for, at kinesiske minkfarme kan have spillet en rolle i fremkomsten af COVID-19 . I partnerskab med videnskabsjournalist Yves Sciama gennemførte de en undersøgelse for Reporterre mellem november og december 2020. Dagen efter blev overførsel af virussen fra mink til mennesker og mutationer relateret til mink dokumenteret i tidsskriftet Science , hvilket fik regeringen til at at fremføre udgangen af ​​2020 et forbud mod minkopdræt, der efter planen træder i kraft i 2024. Efter opdagelsen i Holland iværksatte myndighederne i Danmark et omfattende overvågningsprogram for alle minkfarme i landet med regelmæssig testning og genomisk sekventering. Sekvenserne af de danske og hollandske mink-relaterede vira blev deponeret i GISAID- databasen. Det amerikanske landbrugsministerium (USDA) bekræftede, at tilfælde af mink, der var syge med COVID-19, var blevet dokumenteret i Utah i august 2020. Yderligere udbrud er blevet påvist i Michigan , Wisconsin og Oregon . Den 29. november 2020 er der blevet rapporteret COVID-19-infektioner i mink i Danmark, Italien, Holland, Spanien, Sverige og USA.

Klassifikation

I Danmark har der været fem klynger af minkvarianter af SARS-CoV-2; Danish State Serum Institute (SSI) har betegnet disse som klynger 1–5 (dansk: klynge 1–5 ). I klynge 5, også kaldet ΔFVI -spike af SSI, er flere forskellige mutationer i virusets spike -protein blevet bekræftet. De specifikke mutationer omfatter 69–70deltaHV (en deletion af histidin- og valinresterne på 69. og 70. position i proteinet), Y453F (en ændring fra tyrosin til phenylalanin i position 453, inde i spike-proteinets receptorbindende domæne), I692V ( isoleucin til valin i position 692), M1229I ( methionin til isoleucin i position 1229) og en ikke-konservativ substitution S1147L.

Mink-relaterede mutationer, der delvist ligner de mutationer, der blev opdaget i Danmark, selvom de er en del af en separat genomisk gruppe, er kendt fra Holland.

Konsekvenser for menneskers sundhed

Den 5. november rapporterede BBC News , at der var blevet opdaget 12 tilfælde af human infektion med klynge 5 -varianten. En uge senere viste en ECDC-rapport om hurtig risikovurdering, at 214 minkrelaterede menneskelige tilfælde var forekommet, men få af disse, hvis nogen, menes at have været yderligere tilfælde relateret til klynge 5-udbruddet. Det samlede antal menneskelige tilfælde må ikke have overskredet de oprindeligt rapporterede 12. Senest 20. november blev der ikke påvist yderligere menneskelige tilfælde af klynge 5 -stammen på trods af udbredt genetisk sekventering, der afslørede 750 tilfælde relateret til mink, og det blev vurderet, at klyngen 5 -variant cirkulerede ikke længere hos mennesker.

Historie

Opdagelse

Den 2. november 2020 opdagede det danske statsejede uafhængige forskningsinstitut Statens Serum Institut (SSI) muterede varianter af SARS-CoV-2, som mennesker kan blive smittet af og kunne have farlige virkninger i minkfarme i landet med en sammenhæng mellem mennesker infektioner og 191 positive minkfarme. De offentliggjorde dette offentligt den 3. november og kaldte varianter med en kendt tilknytning til tre gårde "Cluster 5". Den 4. november 2020 udtalte Danmarks statsminister Mette Frederiksen , at en muteret coronavirus blev overført til mennesker via mink, primært knyttet til minkfarme i Nordjylland . En rapport fra SSI viste, at der havde været 12 infektioner hos mennesker (8 direkte forbundet med minkfarme, 4 i det nærliggende samfund), der involverede denne mutation i Nordjylland (kaldet "klynge 5"), og dens antistofrespons var svagere . Mens instituttet erklærede, at mutationen tilsyneladende ikke var mere farlig end andre coronavirus alene, advarede Kåre Mølbak og Tyra Grove Krause fra SSI om, at mutationen potentielt kunne reducere effekten af COVID-19-vacciner, der er under udvikling, selvom det var usandsynligt at gøre dem ubrugelige. Endvidere viste det sig, at det svagere antistofrespons reducerede immunitet opnået ved en tidligere infektion. SSI bemærkede, at selvom klynge 5 var en vis bekymring, var de også bekymrede over potentielle fremtidige mutationer, der kunne forekomme i mink, hvilket førte til deres anbefaling om at lukke alle gårde i landet.

Lockdown og aflivning

Som en forebyggende foranstaltning meddelte Frederiksen, at landet allerede var i gang med at slippe sin minkbestand på cirka 14 millioner (indledende rapporter på 15–17 millioner var baseret på skøn fra tidligere år, hvor industrien var større). For at forhindre spredning af mutationen blev det også annonceret den 5. november, at en lockdown og bevægelsesrestriktioner ville blive implementeret i de nordjyske kommuner Brønderslev , Frederikshavn , Hjørring , Jammerbugt , Læsø , Thisted og Vesthimmerland med virkning den 6. november, Alle kulturinstitutioner , biografer, teatre, sports- og fritidsfaciliteter og spisesteder blev beordret lukket, og rejser til eller ud af kommunerne var forbudt. Offentlig transport blev indstillet 9. november. Massetestning blev indledt (Danmark havde allerede en af ​​verdens højeste testhastigheder ), og sporprogrammer blev yderligere opskaleret. Begrænsningerne i Nordjylland var oprindeligt planlagt til at vare indtil den 3. december, men de kunne vendes tidligere afhængigt af hastigheden på mink-slagtning og massetest af mennesker, og hvis der ikke blev fundet nye tilfælde af klynge 5.

WHO offentliggjorde en erklæring om SARS-CoV-2-varianter den 6. november. Det forklarede, at denne klynge havde en kombination af mutationer, der ikke tidligere var blevet observeret. Varianten havde moderat nedsat følsomhed over for neutraliserende antistoffer, men yderligere undersøgelser ville være påkrævet for at forstå implikationer vedrørende diagnostik, terapi og vacciner. Dette blev senere gentaget i en risikovurdering udgivet af European Center for Disease Prevention and Control (ECDC), der bemærker, at risikoen for de minkrelaterede varianter svarer til den generelle COVID-19-risiko, men kan revurderes, hvis bekymringerne rejst vedrørende immunitet , geninfektion , vaccination og behandling bekræftes især når det kommer til klynge 5, og bemærker også, at viruscirkulation i minkfarme kan udgøre andre problemer i fremtiden og give retningslinjer for håndtering af risikoen. I slutningen af ​​november var mere end 10 millioner blevet slettet.

Internationale reaktioner

Den 6. november meddelte Det Forenede Kongerige, at Danmark ville blive fjernet fra "korridoren" hvidliste over lande, hvorfra rejsende kan vende tilbage uden selvisolering i 14 dage, med henvisning til klynge-5-varianten. Den 7. november meddelte Det Forenede Kongerige, at det også ville forbyde indrejse fra udlændinge, der rejser fra Danmark, og ikke-hjemmehørende, der havde været i Danmark inden for de sidste 14 dage. Britiske borgere fik stadig lov til at vende hjem, men de blev forpligtet til at isolere sig selv i 14 dage såvel som alle andre medlemmer af deres husstand. Dette rejseforbud skulle revideres efter en uge. Begrænsningerne blev til sidst ophævet den 28. november.

Efterspil

Efter massetest meddelte SSI den 19. november 2020, at de ikke havde fundet nye tilfælde af klynge 5, og at det med stor sandsynlighed var uddød. De særlige begrænsninger, der blev lagt på nogle nordjyske kommuner, blev ophævet den 19.-20. november (de er stadig underlagt de standard COVID-19-restriktioner, der dækker hele landet og er ikke relateret til minkmutationerne).

Politiske konsekvenser

Det blev afsløret i slutningen af ​​november, at landbrugsministeren , Mogens Jensen og fem andre ministre var blevet gjort opmærksom på i september, at aflivning af hele landets minkbestand frem for kun dem i de inficerede områder ville være ulovlig. I lyset af opfordringer til fratræden fra den parlamentariske opposition og skarp offentlig kritik erkendte statsminister Frederiksen, at ordren om at fælde alle mink var ulovlig, og Jensen trådte tilbage den 18. november. Der blev senere indgået en aftale om med tilbagevirkende kraft at gøre regeringens kendelse lovlig. Den 21. december 2020 vedtog regeringen og parlamentets venstrefløjspartier i Danmarks parlament et lovforslag, der forbød al minkproduktion i hele 2021. Lovforslaget indeholder ikke bestemmelser om at fjerne det juridiske ansvar for den tidligere aflivning, men lovliggør med tilbagevirkende kraft en bonusudbetaling for hurtigere aflivninger. Oppositionspartierne ( V , C , O , NB , LA ) var imod. Den 25. januar 2021 indgik et flertal i det danske parlament en aftale om at kompensere danske minkbønder og andre, der lever af minkopdræt for mellem 15,6 milliarder og 18,8  DKK ( ca. 2,1 milliarder EUR - ca. 2,5 milliarder EUR).

Se også

Referencer