Institute of Genomics and Integrative Biology - Institute of Genomics and Integrative Biology
 | |
| Forkortelse | CSIR-IGIB |
|---|---|
| Etableret | 1977 |
| Type | Regeringsorganisation |
| Formål | At oversætte begreber udviklet i grundlæggende biologisk forskning til kommercielt levedygtige teknologier til sundhedspleje |
| Beliggenhed | |
Direktør |
Anurag Agrawal |
Forældreorganisation |
Rådet for videnskabelig og industriel forskning |
| Internet side | www |
CSIR Institute of Genomics and Integrative Biology ( CSIR-IGIB ) er et videnskabeligt forskningsinstitut , der primært beskæftiger sig med biologisk forskning. Det er en del af Council of Scientific and Industrial Research (CSIR), Indien.
Instituttet blev grundlagt i 1977 som Center for Biokemisk Teknologi med et primært fokus på biokemisk forskning, men har siden skiftet sit forskningsfokus til integrerende biologi.
Beliggenhed
Instituttet har to campusser i Delhi. North Campus er den ældre af de to campusser og ligger på campus ved Delhi University , på Mall Road overfor Jubilee Hall. Den nye campus er i South Delhi , på Mathura Road ved Sukhdev Vihar.
Historie
IGIB blev etableret i 1977 som Center for Biochemical Technology (CBT). Functional Genomics Unit blev oprettet i 1998 med fokus skiftende fra kemisk til genomisk forskning. Instituttet blev omdøbt til "Institute of Genomics and Integrative Biology" i 2002.
Præstationer
I 2009 sekventerede et team på instituttet genomet for vildtype- zebrafisk med omkring 1,7 milliarder basepar. Dette gjorde fisken, der er hjemmehørende i Himalaya -regionen, den første hvirveldyr, der har hele sit genom sekventeret i Indien, da tidligere indiske forskere kun havde sekventeret bakterier og plantegener.
I december 2009 udførte forskere ved IGIB den første re-sekventering af et menneskeligt genom i Indien. Instituttet samarbejdede også om afkodning af det første srilankanske genom og malaysiske genom. Instituttet er også medlem af Open Personal Genomics Consortium.
Covid-19-pandemi
Instituttet spiller en ledende rolle i forståelsen af nye varianter af SARS-CoV-2 i Indien og i hele verden. Instituttet har også en række informatikressourcer, der er nøglen til identifikation og karakterisering af nye varianter af SARS-CoV-2.
Forskere ved instituttet rapporterede om den første high-throughput næste generations sekventeringsbaserede tilgang til påvisning og genetisk epidemiologi af SARS-CoV-2. Denne fremgangsmåde er blevet udbredt brugt til at forstå den genetiske epidemiologi af SARS-CoV-2 i Kerala , som har betydeligt påvirket politik og beredskab i staten for at bremse spredningen af epidemien samt implementering af bevisbaserede politikker.
Instituttet har været med til at skabe konceptet MegaLabs til COVID-19-test og genomisk overvågning, som også gav den genetiske epidemiologi i stater, herunder Kerala og Andhra Pradesh og Maharashtra
Forskere på instituttet rapporterede også de første tilfælde af geninfektion af COVID-19 i landet bortset fra at identificere en ny klade af SARS-CoV-2 i Indien ved navn I/A3i. Forskere ved instituttet opdagede også en spirende slægt med N440K -mutation i piggprotein forbundet med immunflugt. En omfattende pakke til beregningsressourcer til forståelse af genomer og genetisk epidemiologi af SARS-CoV-2 er blevet vedligeholdt. Et af de første genetisk karakteriserede tilfælde af gennembrudsinfektioner med COVID-19-vaccine blev rapporteret af instituttet.
Forskere ved instituttet har været medvirkende til udviklingen af COVIDSure et Reverse-transkription-polymerasekædereaktionsbaseret kit til diagnose af COVID-19 og er nu meget udbredt i Indien og markedsført af Trivitron Healthcare.
Forskere ved CSIR-IGIB udviklede også testen kaldet FELUDA baseret på CRISPR-genredigering, som er meget effektiv og hurtig til at bekæmpe testkapaciteten i landet og er blevet godkendt af Drug Controller General of India . Testen er licenseret til Tata Group til kommerciel produktion.
Instituttet har også spillet en ledende rolle i det nationale COVID-19 genomics-konsortium og vedligeholder informatikressourcerne og dashboards.
Genomik af sjældne genetiske sygdomme
Instituttet har iværksat et unikt program til at bruge banebrydende genomiske teknologier til at forstå sjældne genetiske sygdomme i Indien og være banebrydende inden for anvendelsen af genomik til præcisionsmedicin i klinikker. Et af de programmer, der er blevet påbegyndt på denne front, er Genomics for Understanding Rare Disease, India Alliance Network (GUaRDIAN). GUaRDIAN er et storstilet samarbejdsnetværk af klinikere fra hele Indien, der forsøger at bruge genomik i klinisk praksis, med det målrettede mål at forstå genetisk struktur af sjældne genetiske sygdomme i Indien.
Konsortiet sigter mod at bruge banebrydende genomisk teknologi til at muliggøre identifikation af genetiske variationer i sygdomme og gøre det muligt for klinikere at nå frem til præcis diagnose for sjælden genetisk sygdom. Bortset fra at arbejde tæt sammen med klinikere har konsortiet til formål at fremme uddannelse, bevidsthed og udbredt anvendelse af genomisk teknologi i kliniske miljøer, ud over at skabe og formidle de højeste standarder for generering og fortolkning af genomisk data i Indien.
I de få år har det været i stand til at arbejde tæt sammen med klinikere i netværket for at kunne tilbyde bevis for principper for anvendelsen af Genomics for Precision Medicine. Et omfattende program til patienthenvisning er også funktionelt.
IndiGen -program for folkesundhed
IndiGen -programmet om Public Health Genomics sigter mod at gennemføre hele genom -sekventering af 1000 indiske individer, der repræsenterer forskellige etniske grupper fra Indien. De data, der genereres som en del af IndiGen, ville give grundlinjen for allelfrekvenser af genetiske varianter til genetisk epidemiologi og bistandspolitiske beslutninger. Frekvenserne af klinisk relevante genetiske varianter ville danne skabelonen til at muliggøre diagnostiske metoder til udbredte genetiske sygdomme og også til optimering af terapier gennem farmakogenomik. En omfattende ressource, der giver søgbar adgang til dataene, gøres også tilgængelig
Udvidelsescentre (filialer)
IGIB's vigtigste campus er placeret på Mall Road, New Delhi nær Delhi University North Campus. IGIB's alliance med Biotech/Pharmaceuticals har ført til dens vækst og oprettelse af to udvidelsescentre - et i South Delhi (IGIB Annex på TCGA, Okhla) og det andet i Western Delhi i Naraina.
Internationale møder
IGIB var medvært for det 13. møde i Human Genome Organization (HUGO) i 2008, afholdt på Hyderabad International Convention Center .