Musgenome Informatik - Mouse Genome Informatics
Mouse Genome Informatics ( MGI ) er en gratis online database og bioinformatik -ressource, der hostes af The Jackson Laboratory , med finansiering fra National Human Genome Research Institute (NHGRI), National Cancer Institute (NCI) og Eunice Kennedy Shriver National Institute of Børns sundhed og menneskelig udvikling (NICHD). MGI giver adgang til data om laboratoriemusens genetik, genomik og biologi for at lette undersøgelsen af menneskers sundhed og sygdom. Databasen integrerer flere projekter, hvor de to største bidrag kommer fra Mouse Genome Database og Mouse Gene Expression Database (GXD). Fra og med 2018 indeholder MGI data kureret fra over 230.000 publikationer.
MGI -ressourcen blev første gang offentliggjort online i 1994 og er en samling af data, værktøjer og analyser, der er skabt og skræddersyet til brug i laboratoriemusen , en meget brugt modelorganisme . Det er "den autoritative kilde til officielle navne for musegener, alleler og stammer", som følger de retningslinjer, der er fastlagt af Den Internationale Komité for Standardiseret Genetisk Nomenklatur for Mus. Historien og fokus for Jackson Laboratory forsknings- og produktionsfaciliteter genererer enorm viden og dybde, som forskere kan mines for at fremme deres forskning. Et dedikeret fællesskab af museforskere, der verden over forbedrer og bidrager også til viden. Dette er et uundværligt værktøj for enhver forsker, der bruger musen som modelorganisme for deres forskning og for forskere, der er interesseret i gener, der deler homologi med musegenerne. Forskellige ressourcer til museforskning, herunder dyresamlinger og gratis kolonistyringssoftware, er også tilgængelige på MGI -stedet.
Musens genomdatabase
Indhold | |
---|---|
Beskrivelse | ressource for pattedyrs genomik og genetik. |
Kontakt | |
Forskningscenter | Jackson Laboratory |
Primær henvisning | Judith Blake & al. (2011) |
Adgang | |
Internet side | http://www.informatics.jax.org |
Download URL | ftp://ftp.informatics.jax.org/ |
De musegenomet Database indsamler og curates omfattende fænotype og funktionelle Anmærkninger for muse -gener og alleler . Dette er en NHGRI -funded projekt, som bidrager til Mouse Genome Informatics database.
Musegenekspressionsdatabase
Indhold | |
---|---|
Beskrivelse | Musens genekspressionsdatabase |
Organismer | Mus musculus |
Kontakt | |
Forskningscenter | Jackson Laboratory |
Primær henvisning | Finger & al. (2011) |
Udgivelses dato | 1996 |
Adgang | |
Internet side | http://www.informatics.jax.org/expression.shtml |
Den Gene Expression Database er et fællesskab ressource af mus udviklingsmæssige ekspression oplysninger.
Se også
- Flybase
- Rotte genomdatabase
- Saccharomyces genomdatabase
- Ormbase
- Xenbase
- Zebrafisk informationsnetværk
Referencer
eksterne links
- Bult, Carol J .; Blake, Judith A .; Smith, Cynthia L .; Kadin, James A .; Richardson, Joel E .; Mouse Genome Database Group (2019-01-08). "Musens genomdatabase (MGD) 2019" . Nucleic Acids Research . 47 (D1): D801 – D806. doi : 10.1093/nar/gky1056 . ISSN 1362-4962 . PMC 6323923 . PMID 30407599 .
- Mouse Genome Informatics hjemmeside
- Smith, Constance M .; Hayamizu, Terry F .; Finger, Jacqueline H .; Bello, Susan M .; McCright, Ingeborg J .; Xu, Jingxia; Baldarelli, Richard M .; Beal, Jonathan S .; Campbell, Jeffrey; Corbani, Lori E .; Frost, Pete J. (2019-01-08). "Musens genekspressionsdatabase (GXD): 2019 -opdatering" . Nucleic Acids Research . 47 (D1): D774 – D779. doi : 10.1093/nar/gky922 . ISSN 1362-4962 . PMC 6324054 . PMID 30335138 .
- Mus Genome Informatics Publications
- Tutorial fra Open Door -værkstedet
- Gene eXpression Database (GXD)