Mycobacterium africanum -Mycobacterium africanum
| Mycobacterium africanum | |
|---|---|
| Videnskabelig klassificering | |
| Domæne: | |
| Phylum: |
" Actinobacteria "
|
| Klasse: | |
| Bestille: | |
| Familie: | |
| Slægt: | |
| Arter: |
M. africanum
|
| Binomisk navn | |
|
Mycobacterium africanum Castets et al. 1969, ATCC 25420
|
|
Mycobacterium africanum er en art af Mycobacterium , der oftest findes i vestafrikanske lande, hvor det anslås at forårsage op til 40% af lungetuberkulose. Symptomerne på infektion ligner dem ved M. tuberculosis .
Det er medlem af Mycobacterium tuberculosis -komplekset .
Taksonomi
Der er syv store slægter i Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC), med slægter 5 og 6 klassificeret som Mycobacterium africanum . MTBC afstamning 5 er M. africanum type 1, vestafrikansk 1 (MAF1), og er klassificeret baseret på en karakteristisk sletning af Region of Differentiation (RD) 711. MAF1 findes almindeligt omkring Guineabugten. MTBC afstamning 6 er også kendt som M. africanum type 1, West African 2 (MAF2), og er klassificeret baseret på en sletning af RD702. MAF2 er udbredt i Vestafrika. M. africanum type 2, østafrikansk, blev tidligere anerkendt som en stamme af Mycobacterium africanum ; det blev for nylig omklassificeret som Mycobacterium tuberculosis genotype “Uganda” i en sublineage af MTBC -slægt 4.
Historie
M. africanum blev først beskrevet som en underart inden for MTBC, med fænotypiske egenskaber mellem M. tuberculosis og M. bovis , baseret på biokemisk test af Castets i 1968. Tidlig genetisk analyse viste, at den var forskellig fra M. tuberculosis på grund af en genomisk RD9 -deletion og tydelig GyrB -nukleotidsekvens og adskilt fra M. bovis på grund af en intakt RD12 og RD4.
Mikrobiologi
M. africanum dyrkes i pyruvatholdige medier under lave iltforhold og danner karakteristiske "dysgoniske" kolonier. I modsætning til M. tuberculosis viser M. africanum katalaseaktivitet, er nitratnegativ og er modtagelig for thiopen-2-carboxylsyrehydrazid (TCH) og pyrazinamid (PZA). M. africanum vokser også langsommere end M. tuberculosis , hvilket typisk tager 10 uger at udvikle kolonier frem for 3 til 4 for M. tuberculosis .
Epidemiologi
M. africanum findes mest i vestafrikanske lande. Det er kun en infektion hos mennesker og spredes ad luftvejen fra personer med åbne tilfælde af sygdom.
Det er ikke helt forstået, hvorfor fordelingen af M. africanum er begrænset til Vestafrika, med kun sporadiske tilfælde fundet i andre regioner. Fylogenetiske beviser viser, at M. africanum på et tidligt tidspunkt forgrenede sig fra moderne Mtb -slægter i Amerika, Europa og Asien. Nogle undersøgelser tyder på, at M. africanum er tilpasset vestafrikanske befolkninger. M. africanum kan blive udkonkurreret af andre Mtb -slægter i andre regioner; genetiske undersøgelser har imidlertid ikke fundet nogen forskel i antallet af virulensgener eller genetisk mangfoldighed mellem M. tuberculosis og M. africanum . Intet dyrereservoir er blevet identificeret for Mycobacterium africanum på trods af at det er fundet forskellige vilde dyr.
Det har en lignende grad af infektiivitet som den normale M. tuberculosis -organisme, men er mindre tilbøjelig til at udvikle sig til klinisk sygdom hos et immunkompetent individ. Imidlertid er M. africanum mere tilbøjelige til at udvikle sig fra infektion til at forårsage sygdom hos en HIV -positiv patient. I lande, hvor M. africanum er endemisk, repræsenterer det en vigtig opportunistisk infektion i de senere stadier af hiv -sygdom.
Patogenese
Det er ikke fuldt ud forstået, hvordan de genetiske forskelle mellem M. africanum og M. tuberculosis giver anledning til den tidligere patogenicitet. Det er imidlertid kendt, at Region of Difference 9 (RD9) mangler i M. africanum, men findes i M. tuberculosis .
M. africanum har også bemærkelsesværdige forskelle i lipidkatabolisme og metabolisme. Derudover forstyrres virulensveje, såsom dosR/Rv0081 regulon eller ESAT-6 regulering i M. africanum .
Behandling
På grund af de lignende symptomer og forskellige vækstbetingelser mellem Mycobacterium tuberculosis og africanum er kulturmetoder upålidelige til diagnose. Molekylærbiologisk baseret genotypering har forbedret identifikationen. Især "spoligotyping" eller "spacer oligonucleotide typing" er en hurtig polymerasekædereaktionsbaseret metode til genotypestammer i MTBC. For nylig er hurtige laterale flowtest blevet udviklet baseret på mpt64 -antigenet, der findes i alle medlemmer af MTBC.
M. africanum har en lavere grad af progression fra latens til aktiv sygdom end M. tuberculosis . M. africanum tuberculosis behandles med et identisk regime til tuberkulose forårsaget af M. tuberculosis . Den samlede helbredelseshastighed er ens, men da flere M. africanum- patienter sandsynligvis er hiv-positive, kan de have højere dødelighed fra anden hiv-relateret sygdom.
Type stamme
ATCC 25420 = CIP 105147
Referencer
Bibliografi
- Skerman, VBD; McGowan, V .; Sneath, PHA (januar 1980). "Godkendte lister over bakterielle navne" . Int. J. Syst. Bakteriol . 30 (1): 225–420. doi : 10.1099/00207713-30-1-225 .