NeuroNames - NeuroNames

NeuroNames
BrainInfo Screen shot 2014-02-01.png
Indhold
Beskrivelse Omfattende hierarkisk nomenklatur for strukturer i primærhjernen (human og makak)
Datatyper
fanget 		Neuroanatomi
Adgang
Internet side http://braininfo.rprc.washington.edu/
Diverse
Licens CC-BY icon.svg
Creative Commons Attribution 3.0 Unported-licens

NeuroNames er en integreret nomenklatur for strukturer i hjernen og rygmarven af de fire arter, der er mest undersøgt af neurovidenskabere: menneske , makak , rotte og mus . Det tilbyder et standard, kontrolleret ordforråd med almindelige navne på strukturer, som er velegnet til utvetydig neuroanatomisk indeksering af information i digitale databaser. Udtryk i standardordforrådet er valgt for at lette udtalen, den mindste værdi og hyppigheden af ​​brugen i nyere neurovidenskabelige publikationer. Strukturer og deres forhold til hinanden er defineret i form af standardordforrådet. I øjeblikket indeholder NeuroNames standardnavne, synonymer og definitioner af cirka 2.500 neuroanatomiske enheder.

Nomenklaturen vedligeholdes af University of Washington og er kernekomponenten i et værktøj kaldet "BrainInfo". BrainInfo hjælper en med at identificere strukturer i hjernen. Man kan enten søge efter et strukturnavn eller lokalisere strukturen i et hjerneatlas og få information som dens placering i det klassiske hjernehierarki, billeder af strukturen, hvilke celler den har, dens forbindelser og gener der udtrykkes der. Oplysninger kan tilgås med et hvilket som helst af omkring 16.000 synonymer på otte sprog.

NeuroNames er et kildeordforråd fra Metathesaurus fra Unified Medical Language System . Det er beskrevet i dybden i de følgende tre videnskabelige artikler :

  • DM Bowden & RF Martin (marts 1995). "NeuroNames hjernehierarki". NeuroImage . 2 (1): 63–83. doi : 10.1006 / nimg.1995.1009 . PMID   9410576 . S2CID   24847350 .
  • DM Bowden & MF Dubach (2003). "NeuroNames 2002". Neuroinformatik . 1 (1): 43-59. doi : 10.1385 / NI: 1: 1: 043 . PMID   15055392 . S2CID   12575028 .
  • DM Bowden; E. sang; J. Kosheleva; MF Dubach (2011). "NeuroNames: En ontologi til BrainInfo-portalen til neurovidenskab på nettet" . Neuroinformatik . 10 (1): 97–114. doi : 10.1007 / s12021-011-9128-8 . PMC   3247656 . PMID   21789500 .

Se også

eksterne links