Marine bakteriofager - Marine bacteriophage
Marine bakteriofager eller marine fager er vira, der lever som obligatoriske parasitmidler i marine bakterier, såsom cyanobakterier . Deres eksistens blev opdaget ved hjælp af elektronmikroskopi og epifluorescensmikroskopi af økologiske vandprøver og senere gennem metagenomisk prøveudtagning af ukulturerede virale prøver. De halede bakteriofager ser ud til at dominere marine økosystemer i antal og mangfoldighed af organismer. Virus, der hører til familierne Corticoviridae , Inoviridae og Microviridae, er imidlertid også kendt for at inficere forskellige marine bakterier. Metagenomisk dokumentation antyder, at mikrovira (icosahedral ssDNA-fager) er særligt udbredt i marine levesteder.
Bakteriofager , vira, der er parasitære på bakterier, blev først opdaget i det tidlige tyvende århundrede. Forskere mener i dag, at deres betydning i økosystemer , især marine økosystemer , er blevet undervurderet, hvilket førte til, at disse infektiøse stoffer blev undersøgt dårligt, og deres antal og artsbiologisk mangfoldighed blev meget rapporteret.
Marine fager
Selv om marine fager indtil for nylig er mikroskopiske og i det væsentlige ubemærket af forskere , synes de at være den mest rigelige og forskelligartede form for DNA- replikeringsmiddel på planeten. Der er cirka 4x10 30 fag i havene eller 5x10 7 pr. Milliliter . Kvantificering af marine vira kan udføres ved hjælp af flowcytometri . HTVC010P inficerer en af de mest almindelige marine bakterier, Pelagibacter ubique af SAR11 clade . De ser ud til at have indflydelse på biogeokemiske cyklusser globalt, tilvejebringe og regulere mikrobiel biodiversitet , cirkulere kulstof gennem marine fødevarer og er vigtige for at forhindre bakteriepopulationers eksplosioner . Forskere undersøger potentialet i marine cyanofager, der skal bruges til at forhindre eller vende eutrofiering .
I sedimenter
Marine bakteriofager udgør en vigtig del af deep sea økosystemer . Der er mellem 5x10 12 og 1x10 13 fag pr. Kvadratmeter i dybhavssedimenter, og deres overflod korrelerer tæt med antallet af prokaryoter, der findes i sedimenterne. De er ansvarlige for døden på 80% af de prokaryoter, der findes i sedimenterne, og næsten alle disse dødsfald er forårsaget af cellelysering (sprængning). De spiller derfor en vigtig rolle i at skifte næringsstoffer fra levende former til opløst organisk stof og detritus. Dette forklarer den høje hastighed på næringsstoffer i dybhavsedimenter. Frigivelse af næringsstoffer fra inficerede bakterier stimulerer væksten af uinficerede bakterier, og derefter bliver disse også inficeret. På grund af vigtigheden af dybhavsedimenter i biogeokemiske cyklusser skal marine bakteriofager have indflydelse på kulstof- , kvælstof- og fosforcyklusserne , men den nøjagtige påvirkning forstås i øjeblikket ikke.
Kulstofcyklus
Marine vira kan spille en vigtig rolle i kulstofcyklussen ved at øge effektiviteten af den biologiske pumpe. Argumentet er, at lysis frigiver ustabile forbindelser, såsom aminosyrer og nukleinsyrer , som har en tendens til at blive genanvendt nær overfladen, mens mere ufordøjeligt carbonrigt materiale, som det der findes i cellevægge, sandsynligvis eksporteres til dybere vand. Således er materialet, der eksporteres til dybere farvande af den ' virale shunt ' sandsynligvis mere kulstofrig end det materiale, hvorfra det blev afledt. Dette ville øge effektiviteten af den biologiske pumpe.