RAB5A - RAB5A

RAB5A
Tilgængelige strukturer
PDB	Ortologsøgning : PDBe RCSB
Liste over PDB -id -koder
	1N6H , 1N6I , 1N6K , 1N6L , 1N6N , 1N6O , 1N6P , 1N6R , 1R2Q , 1TU3 , 1TU4 , 3MJH , 4Q9U
Identifikatorer
Aliaser	RAB5A , RAB5, medlem RAS onkogen familie
Eksterne ID'er	OMIM : 179512 MGI : 105926 HomoloGene : 68142 GenCards : RAB5A
Genplacering ( menneske )
Chr.	Kromosom 3 (menneske)
Ende	19.985.175 bp
Gen placering ( mus )
Chr.	Kromosom 17 (mus)
Ende	53.507.680 bp
RNA -udtryksmønster
	; ;
	Flere referenceudtryksdata
Genontologi
Molekylær funktion	• nukleotidbinding ; • BNP -binding ; • GTP -binding ; • GO: 0001948 proteinbinding ; • GO: 0006184 GTPase -aktivitet ; • guanylnukleotidbinding;
Cellulær komponent	• cytoplasmaet ; • Axon terminalen ; • endosomet ; • celle projektion ; • membran ; • synaptiske vesikel ; • melanosomerne ; • flæse ; • plasmamembranen ; • endocytiske vesikel ; • axon ; • neuronal cellelegeme ; • terminal bouton ; • dendritceller ; • somatodendritisk rum ; • tidligt endosomet ; • fagocytisk vesikel ; • actincytoskelettet ; • membran tømmerflåde ; • cytoplasmatisk side af tidlig endosommembran ; • ekstracellulær exosom ; • GO: 0016023 cytoplasmatisk vesikel ; • fagocytisk vesikelmembran ; • cytosol ; • endosommembran ; • clathrin-belagt vesikelmembran ; • tidlig endosommembran ; • tidligt fagosom ; • postsynaptisk tidligt endosom ; • forankret komponent i synaptisk vesikelmembran;
Biologisk proces	• regulering af endocytose ; • regulering af filopodium samling ; • endocytose ; • blodkoagulation ; • receptor internalisering involveret i kanonisk Wnt signalvej ; • regulering af autophagosome montage ; • synaptisk vesikel genbrug ; • tidlig endosom til sen endosom transport ; • transport ; • protein transport ; • positiv regulering af exocytose ; • regulering af synaptisk vesikeleksocytose ; • regulering af endosomstørrelse ; • viral RNA-genomreplikation ; • fagocytose ; • phosphatidylinositol biosyntetisk proces ; • membranorganisation ; • post-translationel proteinmodifikation ; • intracellulær proteintransport ; • Rab-proteinsignaltransduktion ; • regulering af langsigtet neuronal synaptisk plasticitet ; • amyloid -betaclearance ved transcytose;
	Kilder: Amigo / QuickGO
Ortologer
	5868
	271457
	ENSG00000144566
	ENSMUSG00000017831
	P20339
	Q9CQD1
	NM_004162 ; NM_001292048
	NM_025887
	NP_001278977 ; NP_004153
	NP_080163
	Wikidata
Se/rediger menneske	Se/rediger mus

Ras-relateret protein Rab-5A er et protein, der hos mennesker er kodet af RAB5A- genet .

Fungere

RAB5A lokaliserer til tidlige endosomer, hvor det er involveret i rekruttering af RAB7A og modning af disse rum til sene endosomer. Det driver modning af endosomer ved at transportere vakuolære (H+)-ATPaser (V-ATPaser) fra trans-Golgi-netværk til endocytiske vesikler.

Interaktioner

RAB5A har vist sig at interagere med:

Referencer

Yderligere læsning

Bucci C, Parton RG, Mather IH, Stunnenberg H, Simons K, Hoflack B, Zerial M (sep 1992). "Den lille GTPase rab5 fungerer som en regulerende faktor i den tidlige endocytiske vej" . Celle . 70 (5): 715–28. doi : 10.1016/0092-8674 (92) 90306-W . PMID 1516130 .
Zahraoui A, Touchot N, Chardin P, Tavitian A (jul 1989). "De humane Rab-gener koder for en familie af GTP-bindende proteiner relateret til gær YPT1- og SEC4-produkter, der er involveret i sekretion" . Journal of Biological Chemistry . 264 (21): 12394–401. doi : 10.1016/S0021-9258 (18) 63872-4 . PMID 2501306 .
Farnsworth CC, Seabra MC, Ericsson LH, Gelb MH, Glomset JA (dec 1994). "Rab geranylgeranyl transferase katalyserer geranylgeranylering af tilstødende cystein i de små GTPaser Rab1A, Rab3A og Rab5A" . Procedurer fra National Academy of Sciences i Amerikas Forenede Stater . 91 (25): 11963–7. doi : 10.1073/pnas.91.25.11963 . PMC 45356 . PMID 7991565 .
Cremers FP, Armstrong SA, Seabra MC, Brown MS, Goldstein JL (jan. 1994). "REP-2, et Rab escortprotein kodet af det choroideræmi-lignende gen" . Journal of Biological Chemistry . 269 (3): 2111–7. doi : 10.1016/S0021-9258 (17) 42142-9 . PMID 8294464 .
Stenmark H, Vitale G, Ullrich O, Zerial M (nov. 1995). "Rabaptin-5 er en direkte effektor af den lille GTPase Rab5 i fusion af endocytisk membran" . Celle . 83 (3): 423–32. doi : 10.1016/0092-8674 (95) 90120-5 . PMID 8521472 . S2CID 18768939 .
Vita F, Soranzo MR, Borelli V, Bertoncin P, Zabucchi G (sep 1996). "Subcellulær lokalisering af den lille GTPase Rab5a i hvilende og stimulerede humane neutrofiler". Eksperimentel celleforskning . 227 (2): 367–73. doi : 10.1006/excr.1996.0286 . PMID 8831575 .
Xiao GH, Shoarinejad F, Jin F, Golemis EA, Yeung RS (mar. 1997). "Genproduktet tuberous sclerosis 2, tuberin, fungerer som et Rab5 GTPase -aktiverende protein (GAP) til modulering af endocytose" . Journal of Biological Chemistry . 272 (10): 6097–100. doi : 10.1074/jbc.272.10.6097 . PMID 9045618 .
Simonsen A, Lippé R, Christoforidis S, Gaullier JM, Brech A, Callaghan J, Toh BH, Murphy C, Zerial M, Stenmark H (jul 1998). "EEA1 forbinder PI (3) K -funktion med Rab5 -regulering af endosomfusion". Natur . 394 (6692): 494–8. doi : 10.1038/28879 . PMID 9697774 . S2CID 4305220 .
Anant JS, Desnoyers L, Machius M, Demeler B, Hansen JC, Westover KD, Deisenhofer J, Seabra MC (sep 1998). "Mekanisme for Rab geranylgeranylering: dannelse af det katalytiske ternære kompleks". Biokemi . 37 (36): 12559–68. doi : 10.1021/bi980881a . PMID 9730828 .
Bucci C, Chiariello M, Lattero D, Maiorano M, Bruni CB (maj 1999). "Interaktionskloning og karakterisering af cDNA, der koder for den humane prenylerede rab -acceptor (PRA1)". Biokemisk og biofysisk forskningskommunikation . 258 (3): 657–62. doi : 10.1006/bbrc.1999.0651 . PMID 10329441 .
Callaghan J, Nixon S, Bucci C, Toh BH, Stenmark H (okt. 1999). "Direkte interaktion mellem EEA1 og Rab5b" . European Journal of Biochemistry / FEBS . 265 (1): 361–6. doi : 10.1046/j.1432-1327.1999.00743.x . PMID 10491193 .
Shisheva A, Chinni SR, DeMarco C (sep 1999). "Generel rolle for BNP -dissociationshæmmer 2 i membranfrigivelse af Rab -proteiner: moduleringer af dets funktionelle interaktioner ved in vitro og in vivo strukturelle ændringer". Biokemi . 38 (36): 11711–21. doi : 10.1021/bi990200r . PMID 10512627 .
Masuda ES, Luo Y, Young C, Shen M, Rossi AB, Huang BC, Yu S, Bennett MK, Payan DG, Scheller RH (mar 2000). "Rab37 er en ny mastcelle -specifik GTPase lokaliseret til sekretoriske granuler". FEBS Breve . 470 (1): 61–4. doi : 10.1016/S0014-5793 (00) 01288-6 . PMID 10722846 . S2CID 38218555 .
Hoffenberg S, Liu X, Nikolova L, Hall HS, Dai W, Baughn RE, Dickey BF, Barbieri MA, Aballay A, Stahl PD, Knoll BJ (august 2000). "Et nyt membranforankret Rab5-interagerende protein påkrævet til homotypisk endosomfusion" . Journal of Biological Chemistry . 275 (32): 24661–9. doi : 10.1074/jbc.M909600199 . PMID 10818110 .
Nielsen E, Christoforidis S, Uttenweiler-Joseph S, Miaczynska M, Dewitte F, Wilm M, Hoflack B, Zerial M (okt 2000). "Rabenosyn-5, en ny Rab5-effektor, er kompleks med hVPS45 og rekrutteret til endosomer gennem et FYVE-fingerdomæne" . Journal of Cell Biology . 151 (3): 601–12. doi : 10.1083/jcb.151.3.601 . PMC 2185588 . PMID 11062261 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (nov 2000). "DNA-kloning ved anvendelse af in vitro stedsspecifik rekombination" . Genomforskning . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Lanzetti L, Rybin V, Malabarba MG, Christoforidis S, Scita G, Zerial M, Di Fiore PP (nov 2000). "Eps8 -proteinet koordinerer EGF -receptorsignalering gennem Rac og handel med Rab5". Natur . 408 (6810): 374–7. doi : 10.1038/35042605 . PMID 11099046 . S2CID 4405293 .
Wolf RM, Wilkes JJ, Chao MV, Resh MD (okt 2001). "Tyrosinphosphorylering af p190 RhoGAP af Fyn regulerer oligodendrocytdifferentiering". Journal of Neurobiology . 49 (1): 62–78. doi : 10.1002/neu.1066 . PMID 11536198 .
Seachrist JL, Laporte SA, Dale LB, Babwah AV, Caron MG, Anborgh PH, Ferguson SS (jan 2002). "Rab5 -forbindelse med angiotensin II type 1A -receptoren fremmer Rab5 GTP -binding og vesikulær fusion" . Journal of Biological Chemistry . 277 (1): 679–85. doi : 10.1074/jbc.M109022200 . PMID 11682489 .

Languages

In other projects

RAB5A - RAB5A

Indhold

Fungere

Interaktioner

Referencer

Yderligere læsning