EMBnet - EMBnet
Det europæiske molekylærbiologiske netværk ( EMBnet ) er et internationalt videnskabeligt netværk og interessegruppe, der har til formål at forbedre bioinformatiktjenesterne ved at samle eksperter og kapaciteter inden for bioinformatik. I 2011 har EMBnet 37 noder fordelt på 32 lande. Knudepunkterne inkluderer bioinformatikrelaterede universitetsafdelinger , forskningsinstitutter og nationale tjenesteudbydere.
Operationer
Hovedopgaven for de fleste EMBnet-noder er at give deres nationale videnskabelige samfund adgang til bioinformatikdatabanker , specialiseret software og tilstrækkelige databehandlingsressourcer og ekspertise. EMBnet arbejder også inden for uddannelse i bioinformatik og softwareudvikling . Eksempler på software skabt af EMBnet medlemmer er: EMBOSS , wEMBOSS, UTOPIA .
EMBnet repræsenterer en bred brugergruppe og arbejder tæt sammen med databaseproducenterne såsom EMBL's European Bioinformatics Institute (EBI), Swiss Institute of Bioinformatics ( Swiss-Prot ), Munich Information Center for Protein Sequences (MIPS), for at levere en ensartet dækning af tjenester i hele Europa . EMBnet er registreret i Holland som en offentlig fond ( Stichting ).
Siden oprettelsen i 1988 har EMBnet udviklet sig fra et uformelt netværk af enkeltpersoner med ansvar for vedligeholdelse af biologiske databaser til den eneste verdensomspændende organisation, der bringer fagfolk inden for bioinformatik til at arbejde sammen for at tjene de voksende områder inden for genetik og molekylærbiologi . Selvom EMBnet overvejende består af akademiske noder, får EMBnet en vigtig ekstra dimension fra sine industrielle medlemmer. EMBnet's succes tiltrækker et stigende antal organisationer uden for Europa til at deltage.
EMBnet har en gennemprøvet infrastruktur til at organisere træningskurser, give teknisk hjælp og hjælpe sine medlemmer effektivt at interagere og reagere på de hastigt skiftende behov inden for biologisk forskning på en måde, som intet institut er i stand til at gøre.
I 2005 oprettede organisationen yderligere typer node for at tillade mere end et medlem pr. Land. Den nye kategoriværdi er "associeret node".
Koordinering og organisering
EMBnet styres af de ordinære generalforsamlinger (AGM) og koordineres af en direktion (EB), der fører tilsyn med aktiviteterne i tre projektudvalg:
- Uddannelsesudvalg (E&T). Uddannelsesstøtte inkluderer en række kurser arrangeret i medlemslandene og sprogene, og udvalget arbejder også med den fortsatte udvikling af online tilgængeligt undervisningsmateriale.
- Udvalg for publicitet og public relations (P&PR). Dette udvalg er ansvarligt for at fremme enhver form for EMBnet-aktiviteter, for annoncering af produkter og tjenester leveret af EMBnet-samfundet samt for at foreslå og udvikle nye strategier, der sigter mod at forbedre EMBnet's synlighed, og at tage sig af offentlige relationer med EMBnet-samfund og relaterede netværk / samfund.
- Udvalg for teknisk leder (TM). TM-pc'en yder hjælp og praktisk hjælp til de deltagende noder og deres brugere.
Præstationer
EMBnet havde de første gopher- og World Wide Web- servere i biologi (CSC BioBox)
EMBnet var den første til at komme med løsninger til daglige databaseopdateringer ved hjælp af Internet (NDT), distribueret databehandling (HASSLE) og effektiv databasebrowsing og -linkning (Sequence Retrieval System, SRS).
Ping-projektet blev oprettet som et middel til kontinuerlig information om netværkseffektivitet i hele Europa .
EMBnet er forpligtet til at bringe den nyeste software algoritmer til brugeren gratis (Extended GCG eller EGCG), og fortsætter med at udvikle state of the art offentlige software ( EMBOSS ).
EMBER : en europæisk multimedie-bioinformatik-uddannelsesressource. EMBER var et EU-finansieret projekt, der havde til formål at udvikle en række multimedie- bioinformatikundervisningsværktøjer. EMBER består af et selvstændigt, interaktivt web-tutorial i bioinformatik og det tilsvarende stand-alone kursus på CD-ROM .
EMBnet-samfundet var involveret i oprettelsen af peer reviewed journal Briefings in Bioinformatics (BiB). BiB blev også støttet af et uddannelsesstipend fra EMBnet.
Den globale organisation for læring, uddannelse og træning af bioinformatik (GOBLET) blev dannet som et nonprofit fundament på EMBnet 2012-årsmøde.
Tidsskrift
 | |
| Disciplin | Bioinformatik |
|---|---|
| Sprog | engelsk |
| Redigeret af | Erik Bongcam-Rudloff |
| Publikationsoplysninger | |
| Historie | 2010-nu |
| Forlægger | EMBnet |
| Frekvens | Kvartalsvis |
| Ja | |
| Standard forkortelser | |
| ISO 4 | EMBnet.journal |
| Indeksering | |
| ISSN |
2226-6089 |
| Links | |
) Fra 1994 og frem til 2009 udgav EMBnet EMBnet.news . Dets primære mål var at bringe information og rapportere om de seneste nyheder og udviklinger fra netværket til brugerfællesskabet.
Etableret i 2010 som efterfølgeren til EMBnet.news (med volumenummerering fortsætter uafbrudt), EMBnet.journal er en peer-reviewed videnskabelig open access- tidsskrift, der offentliggør originale forsknings- og tekniske artikler inden for bioinformatik . Tidsskriftet indeholder to hovedafsnit, en til forskningsartikler, anmeldelser og tekniske noter og en til ikke-peer-reviewed kommentarer, reportage, brugervejledninger, træningsoplysninger og nyheder. EMBnet.journal udgiver også konferencesager og møderabstrakt som supplement.