PDXK - PDXK

PDXK
Tilgængelige strukturer
PDB	Ortologsøgning : PDBe RCSB
Liste over PDB -id -koder
	2AJP , 2F7K , 2YXT , 2YXU , 3FHX , 3FHY , 3KEU , 4EN4 , 4EOH
Identifikatorer
Aliaser	PDXK , C21orf124, C21orf97, HEL-S-1a, PKH, PNK, PRED79, pyridoxal (pyridoxin, vitamin B6) kinase, pyridoxal kinase, HMSN6C
Eksterne ID'er	OMIM : 179020 MGI : 1351869 HomoloGene : 2731 GeneCards : PDXK
Genplacering ( menneske )
Chr.	Kromosom 21 (menneske)
Ende	43.762.307 bp
Gen placering ( mus )
Chr.	Kromosom 10 (mus)
Ende	78.464.975 bp
RNA -udtryksmønster
	; ; ; ;
	Flere referenceudtryksdata
Genontologi
Molekylær funktion	• transferaseaktivitet ; • nukleotid binding ; • protein homodimerisering aktivitet ; • pyridoxal kinaseaktivitet ; • zinkion bindende ; • kaliumion binding ; • natriumion binding ; • metalionbinding ; • kinaseaktivitet ; • lithiumion bindende ; • pyridoxalphosphat binding ; • ATP-binding ; • magnesiumioner bindende;
Cellulær komponent	• cytosol ; • ekstracellulær exosom ; • kerne ; • ekstracellulær region ; • cytoplasma ; • sekretorisk granul lumen ; • specifikt granul lumen ; • nukleoplasma;
Biologisk proces	• pyridoxalphosphat biosyntetisk proces ; • fosforylering ; • pyridoxal 5'-phosphat bjærgning ; • cellepopulation spredning ; • neutrofil degranulering ; • vitamin B6 metabolisk proces;
	Kilder: Amigo / QuickGO
Ortologer
	8566
	216134
	ENSG00000160209
	ENSMUSG00000032788
	O00764
	Q8K183
	NM_003681 ; NM_021941 ; NM_001331030
	NM_172134
	NP_001317959 ; NP_003672
	NP_742146
	Wikidata
Se/rediger menneske	Se/rediger mus

Pyridoxalkinase er et enzym, der hos mennesker er kodet af PDXK -genet .

Proteinet kodet af dette gen phosphorylerer vitamin B ₆ , et trin der kræves til omdannelse af vitamin B ₆ til pyridoxal-5-phosphat , en vigtig cofaktor i formidlende stofskifte . Det kodede protein er cytoplasmatisk og fungerer sandsynligvis som en homodimer . Alternativt er splejset transkriptvarianter blevet beskrevet, men deres biologiske validitet er ikke blevet bestemt.

Referencer

Yderligere læsning

Chern CJ, Beutler E (1976). "Biokemiske og elektroforetiske undersøgelser af erythrocytpyridoxinkinase hos hvide og sorte amerikanere" . Er. J. Hum. Genet . 28 (1): 9–17. PMC 1684914 . PMID 2009 .
Merrill AH, Henderson JM, Wang E, et al. (1984). "Metabolisme af vitamin B-6 i menneskelig lever". J. Nutr . 114 (9): 1664–74. doi : 10.1093/jn/114.9.1664 . PMID 6088736 .
Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: en simpel metode til at erstatte capstrukturen af eukaryote mRNA'er med oligoribonucleotider". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Zhang Z, Smith E, Surowiec SM, et al. (1993). "Syntese af N- (4'-pyridoxyl) sphingosin og dets optagelse og metabolisme af isolerede celler". Membranbiokemi . 10 (1): 53–9. doi : 10.3109/09687689309150252 . PMID 8510562 .
Lainé-Cessac P, Cailleux A, Allain P (1997). "Mekanismer til inhibering af human erythrocytpyridoxalkinase med lægemidler". Biochem. Pharmacol . 54 (8): 863–70. doi : 10.1016/S0006-2952 (97) 00252-9 . PMID 9354586 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). "Konstruktion og karakterisering af et fuldt længdeberiget og et 5'-ende-beriget cDNA-bibliotek". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Hattori M, Fujiyama A, Taylor TD, et al. (2000). "DNA -sekvensen af humant kromosom 21" . Natur . 405 (6784): 311–9. Bibcode : 2000Natur.405..311H . doi : 10.1038/35012518 . PMID 10830953 .
Lee HS, Moon BJ, Choi SY, Kwon OS (2001). "Human pyridoxal kinase: overekspression og egenskaber af det rekombinante enzym". Mol. Celler . 10 (4): 452–9. PMID 10987144 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering og indledende analyse af mere end 15.000 cDNA-sekvenser i fuld længde af mennesker og mus" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Komplet sekventering og karakterisering af 21.243 humane cDNA'er i fuld længde" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Shin JH, Weitzdoerfer R, Fountoulakis M, Lubec G (2004). "Ekspression af cystathionin beta-syntase, pyridoxal kinase og ES1 proteinhomolog (mitokondriel forløber) i føtal Downs syndrom-hjerne". Neurochem. Int . 45 (1): 73–9. doi : 10.1016/j.neuint.2003.12.004 . PMID 15082224 . S2CID 20620865 .
Fang X, Zhou ZM, Lu L, et al. (2004). "Ekspression af en ny pyridoxal kinase mRNA splejsningsvariant, PKH-T, i humane testikler". Asiatiske J. Androl . 6 (2): 83–91. PMID 15154080 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Status, kvalitet og udvidelse af NIH cDNA-projektet i fuld længde: Mammalian Gene Collection (MGC)" . Genom Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Wang L, Zhu YF, Guo XJ, et al. (2006). "Et todimensionalt elektroforese-referencekort over menneskelig æggestok". J. Mol. Med . 83 (10): 812–21. doi : 10.1007/s00109-005-0676-y . PMID 16021519 . S2CID 6644433 .
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). "Diversificering af transkriptionel modulering: Identifikation og karakterisering i stor skala af formodede alternative promotorer af menneskelige gener" . Genom Res . 16 (1): 55–65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .
Flanagan JM, Beutler E (2006). "Det genetiske grundlag for variation i menneskelig erythrocytpyridoxalkinaseaktivitet". Hæmatologisk . 91 (6): 801–4. PMID 16704963 .
Hu YH, Warnatz HJ, Vanhecke D, et al. (2006). "Cell array-baseret intracellulær lokaliseringsscreening afslører nye funktionelle træk ved humane kromosom 21 proteiner" . BMC Genomics . 7 : 155. doi : 10.1186/1471-2164-7-155 . PMC 1526728 . PMID 16780588 .
Musayev FN, di Salvo ML, Ko TP, et al. (2007). "Krystalstruktur af human pyridoxalkinase: Strukturelt grundlag for M+ og M2+ aktivering" . Protein Sci . 16 (10): 2184–94. doi : 10.1110/ps.073022107 . PMC 2204131 . PMID 17766369 .

Denne artikel om et gen på humant kromosom 21 er en stub . Du kan hjælpe Wikipedia ved at udvide den .

Languages

In other projects

PDXK - PDXK

Referencer

Yderligere læsning