60S ribosomalt protein L5 - 60S ribosomal protein L5

RPL5
Tilgængelige strukturer
PDB	Ortologsøgning : PDBe RCSB
Liste over PDB -id -koder
	4UG0 , 4V6X , 5AJ0 , 4UJD , 4D67 , 4D5Y , 4UJE , 4UJC
Identifikatorer
Aliaser	RPL5 , DBA6, L5, PPP1R135, MSTP030, Ribosomal protein L5, uL18
Eksterne ID'er	OMIM : 603634 MGI : 102854 HomoloGene : 110649 GeneCards : RPL5
Genplacering ( menneske )
Chr.	Kromosom 1 (menneske)
Ende	92.841.924 bp
Gen placering ( mus )
Chr.	Kromosom 5 (mus)
Ende	107.909.005 bp
RNA -udtryksmønster
	; ; ; ;
	Flere referenceudtryksdata
Genontologi
Molekylær funktion	• rRNA-binding ; • GO: 0001948 proteinbinding ; • RNA-binding ; • strukturel bestanddel af ribosom ; • mRNA 3'-UTR-binding ; • 5S rRNA-binding ; • ubiquitin-proteinligase-binding ; • mRNA 5'-UTR-binding ; • GO: 0090645, GO: 0061637 ubiquitin ligase hæmmeraktivitet;
Cellulær komponent	• cytoplasma ; • cytosol ; • ribosom ; • membran ; • fokal adhæsion ; • intracellulær anatomisk struktur ; • nucleolus ; • cytosolisk stor ribosomal underenhed ; • ekstracellulær exosom ; • kerne ; • nukleoplasma ; • endoplasmatisk retikulum ; • proteinholdigt kompleks ; • synapse ; • ribonukleoproteinkompleks;
Biologisk proces	• viral transkription ; • SRP-afhængig cotranslational protein målrettet mod membran ; • ribosomal stor underenhedsbiogenese ; • translationel initiering ; • atomtranskriberet mRNA katabolisk proces, nonsens-medieret henfald ; • rRNA-behandling ; • ribosomal stor underenhedssamling ; • proteinbiosyntese ; • positiv regulering af genekspression ; • positiv regulering af translation ; • proteinstabilisering ; • GO: 0060564, GO: 1904190 negativ regulering af ubiquitin protein ligaseaktivitet ; • negativ regulering af ubiquitin-afhængig proteinkatabolisk proces ; • negativ regulering af protein neddylering ; • regulering af signaltransduktion af p53-klassemægler;
	Kilder: Amigo / QuickGO
Ortologer
	6125
	100503670
	ENSG00000122406
	ENSMUSG00000058558
	P46777 ; Q5T7N0
	P47962
	NM_000969
	NM_016980
	NP_000960
	NP_058676
	Wikidata
Se/rediger menneske	Se/rediger mus

60S ribosomalt protein L5 er et protein, der hos mennesker er kodet af RPL5 -genet .

Fungere

Ribosomer , organellerne, der katalyserer proteinsyntese , består af en lille 40S -underenhed og en stor 60S -underenhed. Tilsammen består disse underenheder af 4 RNA -arter og cirka 80 strukturelt adskilte proteiner. Dette gen koder for et ribosomalt protein, der er en komponent i 60S -underenheden. Proteinet tilhører L18P -familien af ribosomale proteiner. Det er placeret i cytoplasma . Proteinet binder 5S rRNA til et stabilt kompleks kaldet 5S ribonucleoproteinpartikel (RNP), hvilket er nødvendigt for transport af ikke-ribosom-associeret cytoplasmatisk 5S rRNA til nucleolus til samling i ribosomer. Proteinet interagerer specifikt med beta -underenheden af kaseinkinase 2 .

Klinisk betydning

Variabel ekspression af dette gen i kolorektale kræftformer sammenlignet med tilstødende normale væv er blevet observeret, selvom der ikke er fundet nogen sammenhæng mellem ekspressionsniveauet og sværhedsgraden af sygdommen. Dette gen transkriberes med det lille nukleolære RNA- gen U21, som er placeret i dets femte intron . Som det er typisk for gener, der koder for ribosomale proteiner, er der flere behandlede pseudogener af dette gen dispergeret gennem genomet.

Interaktioner

Ribosomalt protein L5 har vist sig at interagere med:

CSNK2B ,
EIF5A ,
Mdm2 og
PDCD4 .

Referencer

Yderligere læsning

Uld IG, Chan YL, Glück A (1996). "Struktur og udvikling af ribosomale proteiner fra pattedyr". Biochem. Cell Biol . 73 (11–12): 933–47. doi : 10.1139/o95-101 . PMID 8722009 .
Pogue-Geile K, Geiser JR, Shu M, Miller C, Wool IG, Meisler AI, Pipas JM (1991). "Ribosomale proteingener er overudtrykt i kolorektal cancer: isolering af en cDNA -klon, der koder for det humane S3 -ribosomprotein" . Mol. Celle. Biol . 11 (8): 3842–9. doi : 10.1128/MCB.11.8.3842 . PMC 361167 . PMID 1712897 .
Steitz JA, Berg C, Hendrick JP, La Branche-Chabot H, Metspalu A, Rinke J, Yario T (1988). "Et 5S rRNA/L5 -kompleks er en forløber for ribosomsamling i pattedyrsceller" . J. Cell Biol . 106 (3): 545–56. doi : 10.1083/jcb.106.3.545 . PMC 2115095 . PMID 3279045 .
Hirano K, Ito M, Hartshorne DJ (1995). "Interaktion af det ribosomale protein, L5, med proteinphosphatase type 1" . J. Biol. Chem . 270 (34): 19786–90. doi : 10.1074/jbc.270.34.19786 . PMID 7649987 .
Marechal V, Elenbaas B, Piette J, Nicolas JC, Levine AJ (1994). "Det ribosomale L5-protein er forbundet med mdm-2 og mdm-2-p53-komplekser" . Mol. Celle. Biol . 14 (11): 7414–20. doi : 10.1128/mcb.14.11.7414 . PMC 359276 . PMID 7935455 .
Ogata K, Kurahashi A, Nishiyama C, Terao K (1994). "Tilstedeværelse af rolle for 5SrRNA-L5-proteinkomplekset (5SRNP) i threonyl- og histidyl-tRNA-syntetasekomplekset i rotterlevercytosol". Biochim. Biophys. Acta . 1218 (3): 388–400. doi : 10.1016/0167-4781 (94) 90192-9 . PMID 8049265 .
Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: en simpel metode til at erstatte capstrukturen af eukaryote mRNA'er med oligoribonucleotider". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Michael WM, Dreyfuss G (1996). "Særskilte domæner i ribosomalt protein L5 medierer 5 S rRNA -binding og nukleolær lokalisering" . J. Biol. Chem . 271 (19): 11571–4. doi : 10.1074/jbc.271.19.11571 . PMID 8626719 .
Kim JM, Cha JY, Marshak DR, Bae YS (1996). "Interaktion af beta -underenheden af caseinkinase II med det ribosomale protein L5". Biochem. Biophys. Res. Kommun . 226 (1): 180–6. doi : 10.1006/bbrc.1996.1330 . PMID 8806611 .
Boldyreff B, Issinger OG (1997). "A-Raf kinase er en ny interagerende partner for proteinkinase CK2 beta-underenhed" . FEBS Lett . 403 (2): 197–9. doi : 10.1016/S0014-5793 (97) 00010-0 . PMID 9042965 . S2CID 84557809 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstruktion og karakterisering af et fuldt længdeberiget og et 5'-ende-beriget cDNA-bibliotek". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Schatz O, Oft M, Dascher C, Schebesta M, Rosorius O, Jaksche H, Dobrovnik M, Bevec D, Hauber J (1998). "Interaktion af HIV-1 rev cofactor eukaryotisk initieringsfaktor 5A med ribosomalt protein L5" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (4): 1607–12. Bibcode : 1998PNAS ... 95.1607S . doi : 10.1073/pnas.95.4.1607 . PMC 19115 . PMID 9465063 .
Kenmochi N, Kawaguchi T, Rozen S, Davis E, Goodman N, Hudson TJ, Tanaka T, Page DC (1998). "Et kort over 75 humane ribosomale proteingener" . Genom Res . 8 (5): 509–23. doi : 10.1101/gr.8.5.509 . PMID 9582194 .
Jäkel S, Görlich D (1998). "Importin beta, transportin, RanBP5 og RanBP7 formidler atomimport af ribosomproteiner i pattedyrsceller" . EMBO J. . 17 (15): 4491–502. doi : 10.1093/emboj/17.15.4491 . PMC 1170780 . PMID 9687515 .
Guerra B, Issinger OG (1998). "p53 og det ribosomale protein L5 deltager i kompleksdannelse med høj molekylær masse med proteinkinase CK2 i murin teratocarcinomcellelinje F9 efter serumstimulering og cisplatinbehandling" . FEBS Lett . 434 (1–2): 115–20. doi : 10.1016/S0014-5793 (98) 00962-4 . PMID 9738462 . S2CID 7694535 .
Park JW, Bae YS (1999). "Fosforylering af ribosomalt protein L5 ved proteinkinase CKII reducerer dets 5S rRNA -bindingsaktivitet". Biochem. Biophys. Res. Kommun . 263 (2): 475–81. doi : 10.1006/bbrc.1999.1345 . PMID 10491318 .
Rosorius O, Fries B, Stauber RH, Hirschmann N, Bevec D, Hauber J (2000). "Humant ribosomalt protein L5 indeholder defineret nuklear lokalisering og eksportsignaler" . J. Biol. Chem . 275 (16): 12061–8. doi : 10.1074/jbc.275.16.12061 . PMID 10766838 .

Languages

In other projects