Nuclear receptor co -repressor 2 - Nuclear receptor co-repressor 2

NCOR2
Tilgængelige strukturer
PDB	Ortologsøgning : PDBe RCSB
Liste over PDB -id -koder
	2RT5 , 4OAR , 2L5G , 2LTP , 1KKQ , 3R2A , 2ODD , 4A69 , 3R29 , 1XC5 , 1R2B , %% s 1KKQ , 1R2B , 1XC5 , 2GPV , 2LTP , 3R29 , 3R2A , 4A69 , 2L5G , 2ODD , 2RT5 , 4OAR
Identifikatorer
Aliaser	NCOR2 , CTG26, N-CoR2, SMAP270, SMRT, SMRTE, SMRTE-tau, TNRC14, TRAC, TRAC-1, TRAC1, kerneceptor corepressor 2
Eksterne ID'er	OMIM : 600848 MGI : 1337080 HomoloGene : 31370 GeneCards : NCOR2
Genplacering ( menneske )
Chr.	Kromosom 12 (menneske)
Ende	124.567.589 bp
Gen placering ( mus )
Chr.	Kromosom 5 (mus)
Ende	125.179.219 bp
RNA -udtryksmønster
	; ; ; ;
	Flere referenceudtryksdata
Genontologi
Molekylær funktion	• GO: 0001106 transkription corepressor aktivitet ; • protein N-terminal binding ; • histondeacetylase binding ; • Notch binding ; • DNA binding ; • transkriptionsfaktor binding ; • nuklear receptor binding ; • GO: 0001948 protein binding ; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 DNA -binding af transkriptionsfaktoraktivitet, RNA-polymerase II-specifik ; • kromatinbinding ; • sekvensspecifik DNA-binding ; • binding af glucocorticoidreceptor ; • binding af retinsyre-receptor ; • GO: 0032403 proteinholdig kompleksbinding ; • retinoid X-receptorbinding;
Cellulær komponent	• transkriptionsrepressorkompleks ; • atomkrop ; • membran ; • histondeacetylasekompleks ; • nukleare matrix ; • nukleoplasma ; • kerne ; • kromatin;
Biologisk proces	• negativ regulering af produktion af miRNA'er, der er involveret i gen-tavshed ved miRNA ; • regulering af transkription, DNA-skabeloneret ; • transkription, DNA-skabelon ; • negativ regulering af transkription med RNA-polymerase II ; • regulering af lipidmetabolsk proces ; • negativ regulering af transkription, DNA- skabeloneret ; • negativ regulering af androgenreceptorsignalvej ; • laktation ; • respons på organisk nitrogenforbindelse ; • reaktion på østradiol ; • østrig cyklus;
	Kilder: Amigo / QuickGO
Ortologer
	9612
	20602
	ENSG00000196498
	ENSMUSG00000029478
	Q9Y618
	Q9WU42
	NM_006312 ; NM_001077261 ; NM_001206654
	NM_001253904 ; NM_001253905 ; NM_011424
	NP_001070729 ; NP_001193583 ; NP_006303 ; NP_001193583.1
	NP_001240833 ; NP_001240834 ; NP_035554
	Wikidata
Se/rediger menneske	Se/rediger mus

Den nukleare receptor co -repressor 2 ( NCOR2 ) er et transkriptionelt koregulatorisk protein, der indeholder flere nukleare receptor -interagerende domæner. Desuden synes NCOR2 at rekruttere histondeacetylaser til DNA -promotorområder. Derfor hjælper NCOR2 nukleare receptorer i nedreguleringen af målgenekspression . NCOR2 betegnes også som en silencing mediator for retinoid eller thyreoidea-hormon-receptorer ( SMRT ) eller T ₃ receptor-associerende cofaktor 1 ( TRAC-1 ).

Fungere

NCOR2/SMRT er et transkriptionelt koregulatorisk protein, der indeholder flere modulerende funktionelle domæner, herunder flere autonome undertrykkelsesdomæner samt to eller tre C-terminale nukleare receptor-interagerende domæner. NCOR2/SMRT fungerer som en repressiv coregulatorisk faktor ( corepressor ) for flere transskriptionsfaktorveje . I denne henseende fungerer NCOR2/SMRT som et platformprotein, hvilket letter rekruttering af histondeacetylaser til DNA -promotorer bundet af dets interagerende transkriptionsfaktorer.

Familie

Det er medlem af familien af nukleare receptorkorepressorer; det andet humane protein, der er medlem af den familie, er nuklear receptor co-repressor 1 .

Opdagelse

SMRT blev oprindeligt klonet og karakteriseret i laboratoriet hos Dr. Ronald M. Evans ved Salk Institute for Biological Studies. I en anden tidlig undersøgelse af dette molekyle blev lignende fund rapporteret i en variant kaldet TRAC-1.

Interaktioner

Nuclear receptor co-repressor 2 har vist sig at interagere med:

AR ,
BCL6 ,
C-Fos ,
C-jun ,
HDAC1 ,
HDAC3 ,
HDAC4 ,
HDAC5 ,
HDAC10 ,
MeCP2 ,
NR4A1 ,
POU2F1 ,
PPARD ,
PGR ,
PML
RBPJ ,
RELA ,
RUNX1T1 ,
RARA ,
SIN3A ,
SNW1 ,
SPEN ,
SRF ,
TBL1X ,
THRB ,
VDR , og
ZBTB16 .

Referencer

Yderligere læsning

Hörlein AJ, Näär AM, Heinzel T, Torchia J, Gloss B, Kurokawa R, Ryan A, Kamei Y, Söderström M, Glass CK (oktober 1995). "Ligand-uafhængig undertrykkelse af thyreoideahormonreceptoren medieret af en nuklear receptor co-repressor". Natur . 377 (6548): 397–404. Bibcode : 1995Natur.377..397H . doi : 10.1038/377397a0 . PMID 7566114 . S2CID 4230850 .
Chen JD, Evans RM (oktober 1995). "En transkriptionel co-repressor, der interagerer med atomhormonreceptorer". Natur . 377 (6548): 454–7. Bibcode : 1995Natur.377..454C . doi : 10.1038/377454a0 . PMID 7566127 . S2CID 4361329 .
Sande S, Privalsky ML (juli 1996). "Identifikation af TRAC'er (T3-receptorassocierende kofaktorer), en familie af kofaktorer, der associerer med og modulerer aktiviteten af atomhormonreceptorer". Molekylær endokrinologi . 10 (7): 813–25. doi : 10.1210/mig.10.7.813 . PMID 8813722 .
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (september 1996). "Normalisering og subtraktion: to tilgange til at lette genopdagelse" . Genomforskning . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Margolis RL, Abraham MR, Gatchell SB, Li SH, Kidwai AS, Breschel TS, Stine OC, Callahan C, McInnis MG, Ross CA (juli 1997). "cDNA'er med lange CAG -trinucleotid -gentagelser fra menneskelig hjerne". Menneskelig genetik . 100 (1): 114–22. doi : 10.1007/s004390050476 . PMID 9225980 . S2CID 25999127 .
Hong SH, David G, Wong CW, Dejean A, Privalsky ML (august 1997). "SMRT-corepressor interagerer med PLZF og med PML-retinsyre-receptoren alfa (RARalpha) og PLZF-RARalpha-oncoproteiner forbundet med akut promyelocytisk leukæmi" . Procedurer fra National Academy of Sciences i Amerikas Forenede Stater . 94 (17): 9028–33. Bibcode : 1997PNAS ... 94.9028H . doi : 10.1073/pnas.94.17.9028 . PMC 23013 . PMID 9256429 .
Chen H, Lin RJ, Schiltz RL, Chakravarti D, Nash A, Nagy L, Privalsky ML, Nakatani Y, Evans RM (august 1997). "Nuclear receptor coactivator ACTR er en ny histonacetyltransferase og danner et multimerisk aktiveringskompleks med P/CAF og CBP/p300" . Celle . 90 (3): 569–80. doi : 10.1016/S0092-8674 (00) 80516-4 . PMID 9267036 . S2CID 15284825 .
Lin RJ, Nagy L, Inoue S, Shao W, Miller WH, Evans RM (februar 1998). "Histondeacetylasekompleksets rolle ved akut promyelocytisk leukæmi". Natur . 391 (6669): 811–4. Bibcode : 1998Natur.391..811L . doi : 10.1038/35895 . PMID 9486654 . S2CID 4383951 .
Laherty CD, Billin AN, Lavinsky RM, Yochum GS, Bush AC, Sun JM, Mullen TM, Davie JR, Rose DW, Glass CK, Rosenfeld MG, Ayer DE, Eisenman RN (juli 1998). "SAP30, en komponent i mSin3-corepressor-komplekset, der er involveret i N-CoR-medieret undertrykkelse af specifikke transkriptionsfaktorer" . Molekylær celle . 2 (1): 33–42. doi : 10.1016/S1097-2765 (00) 80111-2 . PMID 9702189 .
Liu Y, Takeshita A, Misiti S, Chin WW, Yen PM (oktober 1998). "Manglende koaktivatorinteraktion kan være en mekanisme for dominerende negativ aktivitet af mutante thyreoideahormonreceptorer" . Endokrinologi . 139 (10): 4197–204. doi : 10.1210/endo.139.10.6218 . PMID 9751500 .
Wong CW, Privalsky ML (oktober 1998). "Komponenter i SMRT-corepressorkomplekset udviser karakteristiske interaktioner med POZ-domænet oncoproteiner PLZF, PLZF-RARalpha og BCL-6" . Journal of Biological Chemistry . 273 (42): 27695–702. doi : 10.1074/jbc.273.42.27695 . PMID 9765306 .
Ordentlich P, Downes M, Xie W, Genin A, Spinner NB, Evans RM (marts 1999). "Unikke former for human og mus nuklear receptor corepressor SMRT" . Procedurer fra National Academy of Sciences i Amerikas Forenede Stater . 96 (6): 2639–44. Bibcode : 1999PNAS ... 96.2639O . doi : 10.1073/pnas.96.6.2639 . PMC 15821 . PMID 10077563 .
Park EJ, Schroen DJ, Yang M, Li H, Li L, Chen JD (marts 1999). "SMRTe, en lyddæmpende mediator for retinoid- og skjoldbruskkirtelhormonreceptorer-forlænget isoform, der er mere relateret til den nukleare receptorkorepressor" . Procedurer fra National Academy of Sciences i Amerikas Forenede Stater . 96 (7): 3519–24. Bibcode : 1999PNAS ... 96.3519P . doi : 10.1073/pnas.96.7.3519 . PMC 22325 . PMID 10097068 .
Nguyen TA, Hoivik D, Lee JE, Safe S (juli 1999). "Interaktioner mellem nukleare receptorkoaktivatorer/corepressorproteiner og aryl -carbonhydridreceptorkomplekset". Arkiver for biokemi og biofysik . 367 (2): 250–7. doi : 10.1006/abbi.1999.1282 . PMID 10395741 .
Bailey P, Downes M, Lau P, Harris J, Chen SL, Hamamori Y, Sartorelli V, Muscat GE (juli 1999). "Nuclear receptor corepressor N-CoR regulerer differentiering: N-CoR interagerer direkte med MyoD" . Molekylær endokrinologi . 13 (7): 1155–68. doi : 10.1210/me.13.7.1155 . PMID 10406466 .
Kao HY, Downes M, Ordentlich P, Evans RM (januar 2000). "Isolering af en ny histondeacetylase afslører, at klasse I og klasse II deacetylaser fremmer SMRT-medieret undertrykkelse" . Gener og udvikling . 14 (1): 55–66. doi : 10.1101/gad.14.1.55 (inaktiv 31. maj 2021). PMC 316336 . PMID 10640276 .CS1 -vedligeholdelse: DOI inaktiv fra maj 2021 ( link )
Zhou S, Fujimuro M, Hsieh JJ, Chen L, Miyamoto A, Weinmaster G, Hayward SD (april 2000). "SKIP, et CBF1-associeret protein, interagerer med ankyrin repeat-domænet i NotchIC For at lette NotchIC-funktionen" . Molekylær og cellulær biologi . 20 (7): 2400–10. doi : 10.1128/MCB.20.7.2400-2410.2000 . PMC 85419 . PMID 10713164 .
Lee SK, Kim JH, Lee YC, Cheong J, Lee JW (april 2000). "Tavshedsgiver af retinsyre- og thyreoideahormonreceptorer, som et nyt transskriptionelt corepressormolekyle af aktiverende protein-1, nuklear faktor-kappaB og serumresponsfaktor" . Journal of Biological Chemistry . 275 (17): 12470–4. doi : 10.1074/jbc.275.17.12470 . PMID 10777532 .
Guenther MG, Lane WS, Fischle W, Verdin E, Lazar MA, Shiekhattar R (maj 2000). "Et kerne-SMRT-corepressorkompleks indeholdende HDAC3 og TBL1, et WD40-gentaget protein forbundet med døvhed" . Gener og udvikling . 14 (9): 1048–57. doi : 10.1101/gad.14.9.1048 (inaktiv 31. maj 2021). PMC 316569 . PMID 10809664 .CS1 -vedligeholdelse: DOI inaktiv fra maj 2021 ( link )
Grozinger CM, Schreiber SL (juli 2000). "Regulering af histondeacetylase 4 og 5 og transkriptionel aktivitet ved 14-3-3-afhængig cellulær lokalisering" . Procedurer fra National Academy of Sciences i Amerikas Forenede Stater . 97 (14): 7835–40. Bibcode : 2000PNAS ... 97.7835G . doi : 10.1073/pnas.140199597 . PMC 16631 . PMID 10869435 .

eksterne links

nukleare receptor corepressor 2 på US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
NURSA C98

Languages

In other projects