SMC3 - SMC3

SMC3
Tilgængelige strukturer
FBF Ortologsøgning : PDBe RCSB
Identifikatorer
Aliaser SMC3 , BAM, BMH, CDLS3, CSPG6, HCAP, SMC3L1, strukturel vedligeholdelse af kromosomer 3
Eksterne id'er OMIM : 606062 MGI : 1339795 HomoloGene : 3974 Genkort : SMC3
Ortologer
Arter Human Mus
Entrez

9126

13006
Ensembl

ENSG00000108055

ENSMUSG00000024974
UniProt

Q9UQE7

Q9CW03
RefSeq (mRNA)

NM_005445

NM_007790
RefSeq (protein)

NP_005436

NP_031816
Placering (UCSC) Chr. 10: 110,57 - 110,61 Mb Chr 19: 53,6 - 53,65 Mb
PubMed søgning
Wikidata
Se / rediger menneske Se / rediger musen

Strukturel vedligeholdelse af kromosomprotein 3 (SMC3) er et protein, der hos mennesker er kodet af SMC3- genet . SMC3 er en underenhed af Cohesin- komplekset, som formidler søsterkromatid-samhørighed , homolog rekombination og DNA-looping . Cohesin er dannet af SMC3, SMC1 , RAD21 og enten SA1 eller SA2 . Hos mennesker er SMC3 til stede i alle cohesin-komplekser, mens der er flere paraloger for de andre underenheder.

SMC3 er medlem af SMC-proteinfamilien . Medlemmer af denne familie er nøgleregulatorer for DNA-reparation, kromosomkondensation og kromosomseparation.

Struktur og interaktioner

Struktur af grænsefladen mellem SMC3 (blå) og SMC1 (grøn) (PDB 2WD5) fra mus (Kurze et al., 2009)
Strukturen af ​​grænsefladen mellem SMC3 (blå) og RAD21 (grøn) (PDB 4UX3) fra spirende gær (Gligoris et al., 2014)

Domæneorganisationen af ​​SMC-proteiner er evolutionært konserveret og er sammensat af et N-terminalt Walker A-motiv , spolet spole, "hængsel", spolet spole og et C-terminalt Walker B-motiv . Proteinet foldes tilbage på sig selv for at danne et stangformet molekyle med et heterodimeriserings "hængsel" domæne i den ene ende og et ABC-type ATPase "hoved" i den anden. Disse kugleformede domæner er adskilt af en anti-parallel spiral-spiral på ~ 50 nm. SMC3 og SMC1 binder via deres hængselsdomæner, hvilket skaber V-formede heterodimerer. Det N-terminale domæne af RAD21 binder til den viklede spiral af SMC3 lige over hoveddomænet, mens det C-terminale domæne af RAD21 binder hoveddomænet for SMC1. Denne ende-til-slut-binding af SMC3-SMC1-RAD21-trimeren skaber en lukket ring, inden for hvilken DNA kan indfanges. SA1 eller

Når DNA replikeres, og søsterkromatid samhørighed etableres, acetyleres SMC3 på et par stærkt konserverede lysiner af ESCO1 og ESCO2 . Ved spirende gær er denne modifikation tilstrækkelig til at stabilisere cohesin på DNA indtil mitose, men hos dyr kræves også binding af sororin.

Under meiose danner SMC3 kohæsinkomplekser med SMC1ß , STAG3 og REC8, som genererer sammenhæng mellem homologe kromosomer og søsterkromatider.

Cornelia de Lange syndrom

Cornelia de Lange syndrom (CdLS) er en sjælden genetisk lidelse, der præsenterer med variable kliniske abnormiteter, herunder dysmorfe træk , alvorlig væksthæmning, global udviklingsforsinkelse og intellektuel handicap . SMC3 er en af ​​fem gener, der er blevet impliceret i CdLS. I ét tilfælde rapport, blev en roman SMC3 gen dobbeltarbejde påvist i et barn med manglende trivsel , hypotoni og ansigtstræk dysmorphic funktioner af CdLS. Den samme duplikering blev også observeret hos moderen, som havde mildere dysmorfe facier.

Musemodel

Modelorganismer er blevet brugt i undersøgelsen af ​​SMC3-funktion. En betinget knockout-muselinie , kaldet Smc3 tm1a (EUCOMM) Wtsi, blev genereret som en del af det internationale Knockout Mouse Consortium- program - et mutageneseprojekt med høj kapacitet til at generere og distribuere dyremodeller af sygdomme til interesserede forskere.

Mandlige og kvindelige dyr gennemgik en standardiseret fænotypisk skærm for at bestemme virkningerne af sletning. Toogtyve tests blev udført på mutante mus, og der blev observeret seks signifikante abnormiteter. Ingen homozygote mutante embryoner blev identificeret under drægtigheden, og dermed overlevede ingen før fravænning . De resterende forsøg blev udført på heterozygote mutante voksne mus. Kvinder havde en højere forekomst af død før afvænning hos deres afkom end normalt og havde også en nedsat kropsvægt. Mænds heterozygoter viste en forkortet, vendt snude .

Roll i kældermembran

SMC3 forekommer i visse celletyper, da et udskilt protein, og post-translationel tilsætning af chondroitinsulfatkæder giver anledning til den udskilte proteoglycan bamacan , et rigeligt basalmembranprotein .

Referencer

eksterne links