GATA2 - GATA2

GATA2
PDB 1gnf EBI.jpg
Identifikatorer
Aliaser GATA2 , DCML, IMD21, MONOMAC, NFE1B, GATA -bindende protein 2
Eksterne ID'er OMIM : 137295 MGI : 95662 HomoloGene : 32030 GeneCards : GATA2
Ortologer
Arter Human Mus
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_032638
NM_001145661
NM_001145662

NM_008090
NM_001355253

RefSeq (protein)

NP_001139133
NP_001139134
NP_116027

NP_032116
NP_001342182

Placering (UCSC) Chr 3: 128,48 - 128,49 Mb Chr 6: 88,19 - 88,21 Mb
PubMed søgning
Wikidata
Se/rediger menneske Se/rediger mus

GATA2 eller GATA-bindingsfaktor 2 er en transkriptionsfaktor , altså et nukleært protein, som regulerer ekspressionen af gener . Det regulerer mange gener, der er kritiske for embryonisk udvikling , selvfornyelse , vedligeholdelse og funktionalitet af bloddannende , lympatiske systemdannende og andre vævsdannende stamceller . GATA2 kodes af GATA2 -genet, et gen, der ofte lider af kim- og somatiske mutationer, der fører til en lang række familiære og sporadiske sygdomme. Genet og dets produkt er mål for behandlingen af ​​disse sygdomme.

Inaktiverende mutationer af GATA2 -genet forårsager en reduktion i cellulære niveauer af GATA2 og udviklingen af ​​en lang række familiære hæmatologiske, immunologiske, lymfatiske og/eller andre lidelser, der er grupperet sammen til en almindelig sygdom, der betegnes GATA2 -mangel . Mindre almindeligt er disse lidelser forbundet med ikke-familiære (dvs. sporadiske eller erhvervede) GATA- inaktiverende mutationer. GATA2-mangel begynder ofte med tilsyneladende godartede abnormiteter, men hvis ubehandlet udvikler sig til livstruende opportunistiske infektioner , virusinducerede kræftformer , lungesvigt , myelodysplastisk syndrom (dvs. MDS) og/eller akut myeloid leukæmi , hovedsageligt akut myeloid leukæmi (AML), mindre almindelig kronisk myelomonocytisk leukæmi (CMML), og sjældent en lymfoid leukæmi .

Overekspression af GATA2-transkriptionsfaktoren, der ikke skyldes mutationer i GATA2- genet, ser ud til at være en sekundær faktor, der fremmer aggressiviteten af ​​ikke-familiær EVI1-positiv AML samt progression af prostatakræft .

GATA2 -gen

GATA2 -genet er medlem af den evolutionært konserverede GATA -transkriptionsfaktorgensfamilie . Alle hidtil testede hvirveldyrarter , inklusive mennesker og mus, udtrykker 6 GATA -gener, GATA1 til GATA6 . Det humane GATA2 -gen er placeret på den lange (eller "q") arm af kromosom 3 i position 21.3 (dvs. 3q21.3 -locus) og består af 8 exoner . To steder, betegnet C-ZnF og N-ZnF, af genet kode for to zinkfinger strukturelle motiver af GATA2 transskriptionsfaktoren. Disse steder er kritiske for at regulere transskriptionsfaktorens evne til at stimulere dens målgener.

Den GATA2 genet har mindst fem separate steder, som binder nukleare faktorer, som regulerer dets ekspression. Et særligt vigtigt sådant sted er placeret i intron 4. Dette sted, betegnet 9,5 kb-forstærkeren, er placeret 9,5 kilobaser (dvs. kb) nedstrøms fra genets transkriptinitieringssted og er en kritisk vigtig forstærker af genets ekspression. Regulering af GATA2 -udtryk er yderst kompleks. For eksempel i hæmatologiske stamceller binder GATA2 -transkriptionsfaktoren i sig selv til et af disse steder og er derved en del af funktionelt vigtigt autorisationskredsløb med positiv feedback , hvor transkriptionsfaktoren fremmer sin egen produktion; i et andet eksempel på et positivt feed back -kredsløb stimulerer GATA2 produktionen af Interleukin 1 beta og CXCL2, som virker indirekte for at simulere GATA2 -ekspression. I et eksempel på et negativt feedback -kredsløb forårsager GATA2 -transkriptionsfaktoren indirekte aktivering af den G -proteinkoblede receptor , GPR65 , som derefter virker, også indirekte, til at undertrykke GATA2 -genekspression . I et andet eksempel på negativ tilbagekobling stimulerer GATA2-transkriptionsfaktor ekspressionen af GATA1- transkriptionsfaktoren, som igen kan fortrænge GATA2-transkriptionsfaktor fra dens genstimulerende bindingssteder og derved begrænse GATA2's handlinger.

Det humane GATA2 -gen udtrykkes i hæmatologiske knoglemarvsceller ved stamcellen og senere stamcellestadier i deres udvikling . Stigninger og/eller fald i genets ekspression regulerer selvfornyelse , overlevelse og progression af disse umodne celler mod deres endelige modne former, nemlig erytrocytter , visse typer lymfocytter (dvs. B-celler , NK-celler og T-hjælperceller ) , monocytter , neutrofiler , blodplader , plasmacytoid dendritiske celler , makrofager og mastceller. Genet er ligeledes kritisk for dannelsen af lymfesystemet , især for udviklingen af ​​dets ventiler. Det humane gen udtrykkes også i endotel , nogle ikke-hæmatologiske stamceller, centralnervesystemet og i mindre omfang prostata, endometrium og visse kræftvæv.

Den Gata2 genet i mus har en struktur svarende til dets humane modstykke, Deletion af begge parentale Gata2 gener i mus er dødelig på dag 10 af embryogenese skyldes en total fiasko i dannelsen af modne blodceller . Inaktivering af et mus Gata2 -gen er hverken dødeligt eller forbundet med de fleste tegn på human GATA2 -mangel; disse dyr viser imidlertid en reduktion på ~ 50% i deres hæmatopoietiske stamceller sammen med en reduceret evne til at genbefolke knoglemarven hos musemodtagere. Sidstnævnte fund, humane kliniske undersøgelser og eksperimenter på humant væv understøtter konklusionen om, at begge forældres GATA2 -gener hos mennesker er nødvendige for, at et tilstrækkeligt antal hæmatopoietiske stamceller kan komme ud af det hæmogene endotel under embryogenese og for at disse celler og efterfølgende stamceller kan overleve , forny sig selv og differentieres til modne celler. Efterhånden som personer med GATA2 -mangel ældes, forværres deres mangel på hæmatopoietiske stamceller sandsynligvis som følge af faktorer som infektioner eller andre belastninger. Som følge heraf vises tegn og symptomer på deres sygdom og/eller bliver gradvist mere alvorlige. GATA2 -mangels rolle i at føre til nogen af ​​leukæmityperne forstås ikke. Ligeledes forstås rollen som GATA2-overekspression i ikke-familiær AML såvel som udviklingen af ​​blastkrisen ved kronisk myelogen leukæmi og progression af prostatakræft.

Mutationer

Scores af forskellige typer inaktiverende GATA -mutationer har været forbundet med GATA2 -mangel; disse inkluderer rammeskift , punkt , insertion , splejsesite og deletionsmutationer spredt gennem genet, men koncentreret i regionen, der koder for GATA2-transkriptionsfaktorens C-ZnF-, N-ZnF- og 9,5 kb-steder. Sjældne tilfælde af GATA2 -mangel involverer store mutationssletninger, der omfatter 3q21.3 -locus plus sammenhængende tilstødende gener; disse mutationer synes mere sandsynlige end andre typer GATA -mutationer at forårsage øget modtagelighed for virusinfektioner, udviklingsmæssige lymfatiske lidelser og neurologiske forstyrrelser.

Én GATA2 -mutation er en forstærkning af funktionstype , dvs. den er forbundet med en stigning i aktiviteten frem for niveauer af GATA2. Denne mutation erstatter valin med leucin i 359 aminosyrestillingen (dvs. inden for N-ZnF-stedet) i transkriptionsfaktoren og er blevet påvist hos personer, der gennemgår blastkrisen med kronisk myelogen leukæmi .

Patologisk hæmning

Analyser af personer med AML har opdaget mange tilfælde af GATA2 -mangel, hvor et forældres GATA2 -gen ikke blev muteret, men tavs ved hypermethylering af dets genpromotor . Yderligere undersøgelser er nødvendige for at integrere denne hypermethyleringsinducerede form for GATA2-mangel i den diagnostiske kategori af GATA2-mangel.

Patologisk stimulering

Ikke-mutationsstimulering af GATA2- ekspression og konsekvent aggressivitet i EVI1-positiv AML forekommer på grund af evnen til EVI1 , en transkriptionsfaktor, til direkte at stimulere ekspressionen af GATA2- genet. Årsagen til overekspression af GATA2, der begynder i de tidlige stadier af prostatakræft, er uklar, men kan indebære FOXA1s evne til at virke indirekte for at stimulere ekspressionen af GATA2 -genet.

GATA2

GATA2 -transkriptionsfaktoren i fuld længde er et protein af moderat størrelse, der består af 480 aminosyrer. Af sine to zinkfingre er C-ZnF (placeret mod proteinets C-terminal ) ansvarlig for binding til specifikke DNA- steder, mens dens N-ZnF (placeret mod proteinerne N-terminal ) er ansvarlig for interaktion med forskellige andre nukleare proteiner, der regulere sin aktivitet. Transkriptionsfaktoren indeholder også to transaktiveringsdomæner og et negativt regulatorisk domæne, som interagerer med andre nukleare proteiner for henholdsvis at opregulere og nedregulere dets aktivitet. Ved fremme af hæmatopoiese af embryonisk og/eller voksen type (dvs. modning af hæmatologiske og immunologiske celler) interagerer GATA2 med andre transkriptionsfaktorer (dvs. RUNX1 , SCL/TAL1 , GFI1 , GFI1b , MYB , IKZF1 , transkriptionsfaktor PU.1 , LYL1 ) og cellulære receptorer (dvs. MPL , GPR56 ). I en lang række væv interagerer GATA2 på samme måde med HDAC3 , LMO2 , POU1F1 , POU5F1 , PML SPI1 og ZBTB16 .

GATA2 binder til en specifik nukleinsyresekvens, dvs. (T/A (GATA) A/G), på promotor- og forstærkerstederne for dets målgener og stimulerer eller undertrykker herved ekspressionen af ​​disse målgener. Der er imidlertid tusinder af steder i humant DNA med denne nukleotidsekvens, men af ​​ukendte årsager binder GATA2 sig til <1% af disse. Endvidere binder alle medlemmer af GATA -transkriptionsfaktorfamilien til den samme nukleotidsekvens og kan i visse tilfælde tjene til at forstyrre GATA2 -binding eller endda fortrænge GATA2, der allerede er bundet til disse steder. For eksempel forekommer forskydning af GATA2 -binding til denne sekvens med GATA1 -transkriptionsfaktoren vigtig for den normale udvikling af nogle typer hæmatologiske stamceller. Dette forskydningsfænomen betegnes "GATA -switch". Under alle omstændigheder er GATA2's handlinger, især med henvisning til dets interaktioner med mange andre genregulerende faktorer, ved styring af dets målgener ekstremt komplekse og ikke fuldt ud forstået.

GATA2 -relaterede lidelser

Inaktivering af GATA2 -mutationer

Familie- og sporadiske inaktiverende mutationer i en af ​​de to forældrenes GATA2 -gener forårsager en reduktion, dvs. en haploinsufficiens , i cellulære niveauer af GATA2 -transkriptionsfaktoren. Som følge heraf udvikler enkeltpersoner almindeligvis en sygdom, der kaldes GATA2 -mangel . GATA2-mangel er en gruppering af forskellige kliniske præsentationer, hvor GATA2-haploinsufficiens resulterer i udvikling over tid af hæmatologiske, immunologiske, lymfatiske og/eller andre præsentationer, der kan begynde som tilsyneladende godartede abnormiteter, men som normalt udvikler sig til livstruende opportunistiske infektioner , virusinfektion -inducerede kræftformer , myelodysplastisk syndrom og/eller leukæmier , især AML. De forskellige præsentationer af GATA2 -mangel omfatter alle tilfælde af Monocytopenia og Mycobacterium Avium Complex/Dendritic Cell Monocyte, B og NK Lymfocytmangel (dvs. MonoMAC) og Emberger syndrom samt en betydelig procentdel af tilfælde af familiært myelodysplastisk syndrom/akut myeloid leukæmi , medfødt neutropeni , kronisk myelomonocytisk leukæmi , aplastisk anæmi og flere andre præsentationer .

Aktivering af GATA2 -mutation

L359V -forstærkningen af ​​funktionsmutation (se ovenstående afsnit om mutation) øger aktiviteten af ​​GATA2 -transkriptionsfaktoren. Mutationen opstår under blastkrisen ved kronisk myelogen leukæmi og foreslås at spille en rolle i omdannelsen af ​​de kroniske og/eller accelererede faser af denne sygdom til dens eksplosionskrise fase.

Undertrykkelse af GATA2

Undertrykkelsen af GATA2 -ekspression på grund af methylering af promotorsteder i GATA2 -genet i stedet for en mutation i dette gen er blevet foreslået at være en alternativ årsag til GATA2 -mangelsyndromet. Denne epigenetiske gen-lyddæmpning forekommer også i visse typer ikke-småcellet lungekræft og foreslås at have en beskyttende effekt på sygdommens progression.

Overudtryk af GATA2

Forhøjede niveauer af GATA2 -transkriptionsfaktor på grund af overekspression af dets gen GATA2 er et almindeligt fund i AML. Det er forbundet med en dårlig prognose, synes at fremme sygdommens progression og foreslås derfor at være et mål for terapeutisk intervention. Denne overekspression skyldes ikke mutation, men snarere i det mindste delvist forårsaget af overekspression af EVI1 , en transkriptionsfaktor, der stimulerer GATA2 -ekspression. GATA2- overekspression forekommer også i prostatakræft, hvor det ser ud til at øge metastaser i de tidlige stadier af androgenafhængig sygdom og stimulere overlevelse og proliferation af prostatakræftceller ved at aktivere androgenvejen i androgenuafhængig (dvs. kastrationsresistent) med en ukendt mekanisme sygdom).

Se også

Referencer

Yderligere læsning

eksterne links

Denne artikel indeholder tekst fra United States National Library of Medicine , som er offentligt tilhørende .